Tärkein ero - tyypin I ja tyypin II rajoitusentsyymi
Restriktioentsyymillä, jota yleisemmin kutsutaan restriktioendonukleaasiksi, on kyky pilkkoa DNA-molekyylejä pieniksi fragmenteiksi. Tämä katkaisuprosessi tapahtuu lähellä tai erityisessä DNA-molekyylin tunnistuskohdassa, jota kutsutaan restriktiokohdaksi. Tunnistuskohta koostuu tyypillisesti 4-8 emäsparista. Katkaisukohdasta riippuen restriktioentsyymit voivat olla neljää erilaista tyyppiä; Tyyppi I, tyyppi II, tyyppi III ja tyyppi IV. Katkaisukohdan lisäksi tekijät, kuten koostumus, koekertoimien vaatimus ja kohdesekvenssin kunto, otetaan huomioon erotettaessa restriktioentsyymit neljään ryhmään. DNA-molekyylin pilkkomisen aikana katkaisukohde voi olla joko itse restriktiokohdassa tai etäisyydellä restriktiokohdasta. DNA: n pilkkomisprosessin aikanarestriktioentsyymit luovat kaksi viilloa jokaisen sokerifosfaattirungon läpi DNA: n kaksoiskierteessä. Rajoitusentsyymejä esiintyy pääasiassa Achaeassa ja bakteereissa. He käyttävät näitä entsyymejä puolustusmekanismina hyökkääviä viruksia vastaan. Rajoitusentsyymit pilkkovat vieraan (patogeenisen) DNA: n, mutta eivät omaa DNA: ta. Sen oma DNA suojataan metyylitransferaasina tunnetulla entsyymillä, joka tekee muutoksia isäntä-DNA: ssa ja estää pilkkoutumisen. Tyypin I restriktioentsyymillä on katkaisukohde, joka on poissa tunnistuskohdasta. Tyypin II restriktioentsyymit pilkkovat itse tunnistuskohdassa tai lähempänä sitä. Tämä on keskeinen ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä. Rajoitusentsyymejä esiintyy pääasiassa Achaeassa ja bakteereissa. He käyttävät näitä entsyymejä puolustusmekanismina hyökkääviä viruksia vastaan. Rajoitusentsyymit pilkkovat vieraan (patogeenisen) DNA: n, mutta eivät omaa DNA: ta. Sen oma DNA suojataan metyylitransferaasina tunnetulla entsyymillä, joka tekee muutoksia isäntä-DNA: ssa ja estää pilkkoutumisen. Tyypin I restriktioentsyymillä on katkaisukohde, joka on poissa tunnistuskohdasta. Tyypin II restriktioentsyymit pilkkovat itse tunnistuskohdassa tai lähempänä sitä. Tämä on keskeinen ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä. Rajoitusentsyymejä esiintyy pääasiassa Achaeassa ja bakteereissa. He käyttävät näitä entsyymejä puolustusmekanismina hyökkääviä viruksia vastaan. Rajoitusentsyymit pilkkovat vieraan (patogeenisen) DNA: n, mutta eivät omaa DNA: ta. Sen oma DNA suojataan metyylitransferaasina tunnetulla entsyymillä, joka tekee muutoksia isäntä-DNA: ssa ja estää pilkkoutumisen. Tyypin I restriktioentsyymillä on katkaisukohde, joka on poissa tunnistuskohdasta. Tyypin II restriktioentsyymit pilkkovat itse tunnistuskohdan sisällä tai lähempänä sitä. Tämä on keskeinen ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä. Sen oma DNA suojataan metyylitransferaasina tunnetulla entsyymillä, joka tekee muutoksia isäntä-DNA: ssa ja estää pilkkoutumisen. Tyypin I restriktioentsyymillä on katkaisukohde, joka on kaukana tunnistuskohdasta. Tyypin II restriktioentsyymit pilkkovat itse tunnistuskohdassa tai lähempänä sitä. Tämä on keskeinen ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä. Sen oma DNA suojataan metyylitransferaasina tunnetulla entsyymillä, joka tekee muutoksia isäntä-DNA: ssa ja estää pilkkoutumisen. Tyypin I restriktioentsyymillä on katkaisukohde, joka on poissa tunnistuskohdasta. Tyypin II restriktioentsyymit pilkkovat itse tunnistuskohdassa tai lähempänä sitä. Tämä on keskeinen ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on tyypin I restriktioentsyymi
3. Mikä on tyypin II restriktioentsyymi
4. Tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin yhtäläisyydet
5. Vertailu vierekkäin - tyyppi I vs. tyypin II rajoitusentsyymi taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mikä on tyypin I rajoitusentsyymi?
Tyypin I restriktioentsyymit ovat pentameerisiä proteiineja, jotka koostuvat kolmesta multi-alayksiköstä: restriktio-alayksikkö, metylaatio-alayksikkö ja DNA-sekvenssin tunnistava alayksikkö. Nämä alayksiköt eivät ole identtisiä. Ne tunnistettiin alun perin kahdessa eri Escherichia coli -muodossa. Näiden restriktioentsyymien pilkkomiskohta on läsnä eri satunnaispisteissä, tyypillisesti 1000 emäsparin päässä tunnistuskohdasta. Nämä restriktioentsyymit vaativat ATP: tä, Mg 2+: taja S-adenosyyli-L-metioniini sen aktivaatioon. Tyypin I restriktioentsyymeillä on sekä metylaasi- että restriktioaktiivisuutta. Bakteerit käyttävät restriktioentsyymejä solujen puolustusmekanismina tunkeutuvilta viruksilta. Rajoitusentsyymit pilkkovat virus-DNA: n ja tuhoavat ne. Mutta estääkseen oman isäntänsä DNA: n pilkkoutumisen, tyypin I restriktioentsyymi tarjoaa metylointisuojan. Tämä muuttaa isäntä-DNA: ta ja estää pilkkoutumisen. Vaikka nämä restriktioentsyymit ovat biokemiallisesti tärkeitä, niitä ei käytetä laajalti, koska ne eivät tarjoa erillisiä restriktiofragmentteja tai geelin sitoutumismalleja.
Mitä ovat tyypin II rajoitusentsyymit?
Tyypin II restriktioentsyymit sisältävät rakenteeltaan kaksi identtistä alayksikköä. Homodimeerit muodostetaan tyypin II restriktioentsyymeillä tunnistuskohtien kanssa. Tunnistuskohdat ovat tyypillisesti palindromisia ja jakamattomia. Sen pituus on 4-8 emäsparia. Toisin kuin tyyppi I, tyypin II restriktioentsyymin pilkkomiskohta on läsnä tunnistuskohdassa tai lähellä etäisyyttä tunnistuskohtaan.
Kuva 02: Tyypin II rajoitusentsyymit
Nämä restriktioentsyymit ovat biokemiallisesti merkittäviä ja niitä on laajasti saatavana kaupallisesti. Aktivoimiseksi se vaatii vain Mg 2+. Sillä ei ole metylaatioaktiivisuutta, ja se tarjoaa vain restriktioaktiivisuuden. Nämä restriktioentsyymit sitoutuvat DNA-molekyyleihin homodimeereinä ja kykenevät tunnistamaan symmetriset DNA-sekvenssit sekä epäsymmetriset sekvenssit.
Mitkä ovat tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymien yhtäläisyydet?
- Tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymit ovat entsyymityyppejä, jotka ovat restriktioendonukleaaseja, joihin liittyy DNA-molekyylien pilkkominen pienemmiksi fragmenteiksi.
- Molemmat ovat hyödyllisiä molekyylibiologisissa tekniikoissa.
Mikä on ero tyypin I ja tyypin II restriktioentsyymin välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Tyypin I vs. tyypin II rajoitusentsyymi |
|
| Tyypin I restriktioentsyymi on DNA-restriktioentsyymi, joka katkaisee DNA: n satunnaisissa kohdissa kaukana tunnistuskohdastaan. | Tyypin II restriktioentsyymi on DNA-restriktioentsyymi, joka katkaisee DNA: n määritellyissä paikoissa lähellä tai tunnistuspaikkaa. |
| Sävellys | |
| Tyypin I restriktioentsyymi on monimutkainen entsyymi, joka koostuu kolmesta (03) ei-identtisestä alayksiköstä. | Tyypin II restriktioentsyymi on yksinkertainen entsyymi, joka koostuu kahdesta identtisestä alayksiköstä. |
| Molekyylipaino | |
| Tyypin I restriktioentsyymi painaa 400 000 daltonia. | Tyypin II restriktioentsyymin painoalue on 20000 - 100000 daltonia. |
| Pilkkomisen järjestys | |
| Katkaisusekvenssi ei ole spesifinen tyypin I restriktioentsyymissä. | Tyypin II restriktioentsyymillä on erityinen katkaisusekvenssi. |
| Katkaisupaikka | |
| Katkaisukohde on 1 000 nukleotidia poispäin tyypin I restriktioentsyymien tunnistuskohdasta. | Katkaisukohde on läsnä tyypin II restriktioentsyymin tunnistuskohdassa tai lyhyen matkan päässä tunnistuskohdasta. |
| Kofaktorit aktivointia varten | |
| Tyypin I restriktioentsyymi vaatii aktivointiin ATP: tä, Mg 2+: ta ja S-adenosyyli-L-metioniinia. | Vain Mg2 + tarvitaan aktivoimaan tyypin II restriktioentsyymi. |
| Metylointiaktiviteetti | |
| Tyypin I entsyymi suojaa DNA: ta metyloimalla. | Ei metylaatioaktiivisuutta tyypin II restriktioentsyymeissä. |
| Entsyymin aktiivisuus | |
| Tyypin I restriktioentsyymi tuottaa sekä endonukleaasi (restriktio) että metylaatioaktiivisuutta. | Tyypin II restriktioentsyymi tarjoaa vain restriktioaktiivisuutta. |
| Esimerkkejä | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Yhteenveto - tyypin I vs. tyypin II rajoitusentsyymi
Rajoitusentsyymejä kutsutaan biologisiksi saksiksi, jotka pilkkovat DNA-molekyylit pienemmiksi aineiksi. Rajoitusentsyymit on jaoteltu 04 eri luokkaan katkaisukohdan sijainnin perusteella tunnistuskohdan, läsnä olevien tekijöiden, kohdesekvenssin koostumuksen ja kunnon mukaan. Aktivoimiseksi tyypin I restriktioentsyymit vaativat ATP: tä, Mg 2+ : ta ja S-adenosyyli-L-metioniinia. Tyypin I restriktioentsyymin pilkkoutumiskohta on läsnä tyypillisesti 1000 emäsparin päässä tunnistuskohdasta ja tarjoaa metylaasisuojan DNA: lle. Tyypin II rajoitukset entsyymit vaativat vain Mg 2+: tasen aktivoimiseksi. Katkaisukohde on läsnä tunnistuspaikassa tai lähellä sitä. Sillä ei ole metylaatioaktiivisuutta ja sitä on laajasti saatavilla kaupallisesti. Tämä on ero tyypin I restriktioentsyymin ja tyypin II restriktioentsyymin välillä.
Lataa PDF-versio tyypin I ja tyypin II rajoitusentsyymistä
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainausviestin mukaan. Lataa PDF-versio täältä Ero tyypin I ja tyypin II rajoitusentsyymin välillä.
