Tärkein ero - Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium on bakteerisuku, joka aiheuttaa useita kaksisirkkaisten kasvien sairauksia, kuten kruunun sappitaudin ja karvaisten juurien taudin. Nämä kaksi tautia koodaavat geenit, jotka sijaitsevat bakteerien plasmidissa (ei-kromosomaalinen DNA). Bakteerilajeissa Agrobacterium tumerfaciens on kasvainta indusoiva plasmidi (Ti-plasmidi), joka on vastuussa kasvien kruunusappisairaudesta. Agrobacterium rhizogenes on toinen bakteeri, jolla on juuria indusoiva plasmidi (Ri-plasmidi), joka on vastuussa karvaisen juuren taudista kasveissa. Ti- ja Ri-plasmidit ovat patogeenisiä plasmideja, jotka ovat ainutlaatuisia tälle bakteerisuvulle. Tärkein ero Ti- ja Ri-plasmidin välillä on se, että Ti-plasmidi koodataan geeneillä, jotka ovat vastuussa kruunun sappitaudin aiheuttamisesta, kun taas Ri-plasmidi on koodattu geeneillä karvaisten juurien taudille kasveissa. Nämä patogeeniset plasmidit sisältävät geeniklustereita, jotka vastaavat DNA: n replikaatiosta, virulenssista, T-DNA: sta, opiinin käytöstä ja konjugaatiosta. Infektion aikana Agrobacterium irrottaa plasmidin T-DNA (siirto-DNA) -alueensa ja integroituu kasvin genomiin aiheuttaakseen sairauden. Molekyylibiologit hyödyntävät tätä kykyä tuoda tärkeitä geenejä kasveihin geenitekniikassa. Siksi Agrobacteriumia pidetään tärkeänä välineenä biotekniikassa ja molekyylibiologiassa kimeerisen DNA: n viemiseksi eri kasvilajeihin. Molekyylibiologit hyödyntävät tätä kykyä tuoda tärkeitä geenejä kasveihin geenitekniikassa. Siksi Agrobacteriumia pidetään tärkeänä välineenä biotekniikassa ja molekyylibiologiassa kimeerisen DNA: n viemiseksi eri kasvilajeihin. Molekyylibiologit hyödyntävät tätä kykyä tuoda tärkeitä geenejä kasveihin geenitekniikassa. Siksi Agrobacteriumia pidetään tärkeänä välineenä biotekniikassa ja molekyylibiologiassa kimeerisen DNA: n viemiseksi eri kasvilajeihin.
SISÄLTÖ
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on Ti-plasmidi
3. Mikä on Ri-plasmidi
4. Vertailu rinnakkain - Ti vs Ri-plasmidi
5. Yhteenveto
Mikä on Ti Plasmid?
Kasvainta indusoiva plasmidi (Ti-plasmidi) on suurempi plasmidi, jonka Agrobacterium tumerfaciens pitää yllä aiheuttaen kruunun sappitaudin monenlaisissa dikottikasveissa. Nimeä kruunusappisairaus käytetään johtuen suurten kasvainten, kuten turvotusten, muodostumisesta kasvien kruunussa maanpinnan yläpuolella A. tumerfaciensin aiheuttaman ylimääräisen kasvihormonien auksiinin ja sytokiniinien vuoksi. T-DNA-alue sisältää tuumoria indusoivat geenit. Agrobacterium tumerfaciens tulee kasveihin vahingoittuneiden kasvikudosten kautta, erityisesti haavojen kautta, ja siirtää osan plasmidi-DNA: sta (T-DNA) yhdessä tauteja aiheuttavien geenien kanssa kasvisoluihin. Tämä T-DNA integroituu sitten kasvisolun genomiin ja transkriptoituu. Geenien ilmentyminen aiheuttaa kasvainten muodostumista ja niihin liittyviä muutoksia solujen aineenvaihdunnassa. Kruunun sappitauti ei aiheuta vakavia vahinkoja vanhemmille kasveille. Se kuitenkin heikentää taimitarhojen laatua.
Tämän ainutlaatuisen tartuntatavan vuoksi A. tumerfaciensia käytetään laajalti geenitekniikan työkaluna siirtogeenisten kasvien tuotannossa. Tuumoria indusoivat geenit tukahdutetaan, ja halutut geenit, kuten hyönteismyrkkyjen vastustuskykyiset geenit ja rikkakasvien torjunta-aineille resistentit geenit, lisätään tai yhdistetään Ti-plasmidiin rekombinantti-DNA-tekniikkaa käyttäen ja käytetään kasvinjalostusohjelmissa. Kun T-DNA siirretään A. tumerfaciens -infektion jälkeen kasveihin, kasvit saavat luonnollisesti haluttujen geenien vaikutukset. Siksi mikä tahansa T-DNA: han insertoitu vieras DNA voidaan integroida kasvisolun genomeihin tämän bakteerin luonnollisen infektioprosessin avulla.
Kuva 01: A. tumerfaciensin Ti-plasmidi
Mikä on Ri Plasmid?
Juuria indusoiva plasmidi (Ri-plasmidi) on plasmidi, jota kantaa bakteeri A. rhizogenes. Ri-plasmidi on vastuussa karvaisten juurien taudista nimeltä dicot-kasveissa. A. rhizogenes -infektio aiheuttaa tarttuvien juurien laajan muodostumisen infektiokohdassa tai sen lähellä. Karvaisia juuria indusoivat geenit sijaitsevat Ri-plasmidin T-DNA-alueella. Ri-plasmidi on suurempi plasmidi, joka on samanlainen kuin Ti-plasmidi. A. rizogeenit pystyvät myös siirtämään RI-plasmidin T-DNA-alueen kasvisoluihin ja integroitumaan kasvisolun genomiin transkriptioiden saamiseksi käyttämällä kasvisolukoneistoa sairauksien aiheuttamiseksi. Siksi Ri-plasmidit toimivat myös tärkeinä vektoreina kasvien geenitekniikassa.
Mitä eroa Ti ja Ri Plasmid ovat?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Ti vs Ri Plasmid |
|
| Ti-plasmidi on pyöreä ja suurempi plasmidi, jota A tukee. tumerfaciens | Ri-plasmidi on pyöreä ja suurempi plasmidi, jota A tukee. risogeenit |
| Tauti | |
| Ti-plasmidi koodaa kasvien kruunusappisairauden geenejä | Ri-plasmidi koodaa karvaisten juurisairauksien geenejä dikottikasveissa. |
Yhteenveto - Ti vs Ri Plasmids
Ti- ja Ri-plasmidit ovat patogeenisiä plasmideja, joissa on vastaavasti A. tumerfaciencs ja A. rhizogenes. Ti-plasmidilla on kasvainta indusoivia geenejä, jotka aiheuttavat kasvien kruunusappisairauden. Ri-plasmidilla on juuria indusoivia geenejä, jotka aiheuttavat karvaisia juuritauteja kasveissa. Tämä on suurin ero Ti- ja Ri-plasmidien välillä. Näitä plasmideja voidaan käyttää vektorina kasvigeenitekniikassa johtuen niiden luonnollisesta kyvystä siirtää osa plasmidi-DNA: sta isäntägenomiin. Ne sisältävät geeniklustereita ja ovat kooltaan noin 200 kbp. Jokainen plasmidi sisältää ainutlaatuisia geenejä.
