Keskeinen ero Klenow-fragmentin ja DNA-polymeraasi 1: n välillä on se, että Klenow-fragmentti on suuri osa DNA-polymeraasia 1, jolla ei ole 5 '- 3' eksonukleaasiaktiivisuutta, kun taas DNA-polymeraasi on E. colin entsyymi, jolla on kaikki kolme domeenia, mukaan lukien 5 '- 3'-eksonukleaasiaktiivisuus.
DNA-polymeraasi on yksi tärkeimmistä entsyymeistä, jotka osallistuvat elävien organismien DNA-replikaatioon. Eukaryooteissa ja prokaryooteissa on erilaisia DNA-polymeraasientsyymimuotoja koon ja muodon perusteella. DNA-polymeraasia 1, 2 ja 3 esiintyy vain prokaryoottisissa organismeissa, ja niillä on eri roolit DNA-replikaatiossa. DNA-polymeraasi 1: llä on kolme domeenia, joissa on 5 '- 3' polymeraasi, 3 '- 5' eksonukleaasiaktiivisuus ja 5 '- 3' eksonukleaasiaktiivisuus. Klenow-fragmentti on DNA-polymeraasin 1 proteolyyttinen tuote. Sillä on koskemattoman DNA-polymeraasi 1: n 5 - 3 'polymeraasin ja 3 - 5': n eksonukleaasiaktiivisuutta, mutta sillä ei ole 5 '- 3' eksonukleaasiaktiivisuutta.