Keskeinen ero genomisen ja plasmidi-DNA: n välillä on se, että genominen DNA on välttämätön organismien, myös bakteerien, selviytymiselle, kun taas plasmidi-DNA ei ole välttämätön bakteerien selviytymiselle.
Jokaisella elävällä organismilla on geneettistä materiaalia, joka kontrolloi sen yleistä toimintaa. Geneettinen materiaali esiintyy pääasiassa kromosomaalisena DNA: na. Eukaryooteissa genomista DNA: ta on läsnä ytimen sisällä, kun taas prokaryooteissa genomista DNA: ta esiintyy sytoplasmassa. Joillakin organismeilla, kuten bakteereilla, arkeilla ja hiivalla, on kromosomin ulkopuolinen DNA, joka tunnetaan plasmidi-DNA: na. Plasmidi-DNA ei ole välttämätön näiden organismien päivittäiselle toiminnalle. Ne tarjoavat kuitenkin joitain lisäetuja näille organismeille, koska se sisältää useita tärkeitä geenejä. On myös tärkeää huomata, että nämä geenit eivät ole yhtä elintärkeitä kuin genomisessa DNA: ssa olevat geenit. Joten tässä artikkelissa yritetään keskustella genomisen ja plasmidi-DNA: n välisestä erosta.