Tärkein ero allogeenisen ja autologisen siirron välillä riippuu siirrettävien kantasolujen lähteestä. Allogeeninen siirto käyttää uusia kantasoluja toiselta luovuttajalta, kun taas autologinen siirto käyttää potilaan omia kantasoluja.
Kantasolut ovat erilaistumattomia soluja, jotka voivat jakautua ja erilaistua erilaisiksi muiksi solutyypeiksi. Näin ollen näillä soluilla on kyky itsensä uudistumiseen. Siksi ne ovat perusta elimillemme ja kudoksillemme. Lisäksi ne toimivat kehomme korjausjärjestelmänä. Koska kantasolut pystyvät tuottamaan enemmän samantyyppisiä tytärsoluja tai erilaistumaan tietyiksi solutyypeiksi, niitä käytetään kantasoluterapioissa korvaamaan väärin toimivat tai sairaat kudokset terveillä kudoksilla. Kantasoluterapia voi olla joko allogeenista tai autologista. Se riippuu uusista kantasoluista, joita käytetään korvaamaan kudos elinsiirron yhteydessä. Kantasoluterapiassa, jos käytetyt kantasolut ovat potilaan omia, se tunnetaan autologisena siirteenä. Mutta jos se on peräisin toisesta luovuttajasta, sitä kutsutaan allogeeniseksi elinsiirroksi.
