Keskeinen ero alfa- ja beeta-anomeerien välillä on se, että alfa-anomeerissä hydroksyyliryhmä anomeerisen hiilen kohdalla on cis anomeerikeskuksen eksosykliseen happeen nähden, kun taas beeta-anomeerissa hydroksyyliryhmä on trans-eksosykliseen happeen.
Anomeeri on hiilihydraattien geometrinen vaihtelu. Se on eräänlainen epimeeri, jossa voimme nähdä anomeerisen hiiliatomin. Anomeerinen hiiliatomi on johdettu hiilihydraatin avoimen ketjun rakenteen karbonyylihiilestä. Siksi syklisen rakenteen muodostumista avoimen ketjun rakenteesta kutsutaan anomeroinniksi.