Keskeinen ero agar-kuopan ja levyn diffuusiomenetelmän välillä on, että agar-kuopan diffuusiomenetelmässä uuteliuos täytetään agar-väliaineelle muodostettuun reikään tai kaivoon, kun taas agar-levyn diffuusiomenetelmässä testiliuosta sisältävä suodatinpaperilevy on asetetaan agarin pinnalle.
Mikro-organismit ovat monien sairauksien aiheuttajia. On olemassa erilaisia antimikrobisia aineita, jotka tappavat mikro-organismit ja estävät tai pysäyttävät niiden kasvun. Erilaisia seulonta- ja arviointimenetelmiä on käytettävissä antimikrobisen vaikutuksen havaitsemiseksi. Niistä agar-kaivon diffuusiomenetelmä ja agar-levyn diffuusiomenetelmät ovat yleisesti käytettyjä menetelmiä in vitro -analyysissä, jotka ovat agarin diffuusiomenetelmiä. Näitä menetelmiä käytetään laajalti, koska ne eivät vaadi erityisiä laitteita ja uusittavuuden ja standardoinnin lisäarviointia. Molemmat menetelmät riippuvat antimikrobisen aineen diffuusiosta agar-väliaineen läpi.