Keskeinen ero veri-aivoesteen ja veren CSF-esteen välillä on se, että veri-aivoeste on este, joka erottaa verikudoksen ja aivokudoksen, kun taas veren CSF-este on toiminnallinen este, joka erottaa verikudoksen ja aivo-selkäydinnesteen.
Veren aivoesteet ja veren CSF-esteet ovat kaksi suojaavaa estettä aivoissa. Ne ovat myös tärkeitä molekyylien kuljettamisessa aivojen ja ääreisverenkudosten läpi. Lisäksi molemmilla esteillä on tiukat liitokset, jotka helpottavat myrkyttömien yhdisteiden siirtymistä aivoihin.