Keskeinen ero siirtogeenisten ja knockout-hiirten välillä on, että siirtogeenisten hiirien genomiin on insertoitu vieraita geenejä, kun taas knockout-hiirillä on toiminnallisesti inaktivoitu geeni.
Geenitekniikka on genetiikan ala, jossa organismin geneettistä rakennetta muokataan tai manipuloidaan rekombinantti-DNA-tekniikalla. Siirtogeeniset organismit valmistetaan viemällä vieraita geenejä (siirtogeenejä) organismeihin biotekniikan avulla. Niitä kutsutaan myös geneettisesti muunnetuiksi organismeiksi. Siirtogeeniset organismit ovat arvokkaita tutkimusvälineitä. Ne ovat tärkeitä geenin toiminnan tutkimisessa sekä geeniterapiassa ja maataloudessa. Hiiriä käytetään laboratorioeläinmalleina, koska ne liittyvät läheisemmin ihmisiin. Siirtogeeniset hiiret ja tyrmäyshiiret ovat kahden tyyppisiä geneettisesti muunnettuja eläimiä. Siirtogeenisissä hiirissä isännän DNA lokuksessa korvataan saman geenin eri versiolla tai täysin erilaisella geenillä. Knockout-hiirissä isäntägeeni yksinkertaisesti poistetaan tai inaktivoidaan toiminnallisesti.
