Keskeinen ero Krebs-syklin ja glykolyysin välillä on se, että mitokondrioissa tapahtuva Krebs-sykli on soluhengityksen toinen vaihe, kun taas sytoplasmassa tapahtuva glykolyysi on soluhengityksen ensimmäinen vaihe.
Krebsin sykli ja glykolyysi ovat solun hengityksen kaksi päävaihetta, joka tuottaa energiaa soluissa. Molemmat prosessit tapahtuvat eri solupaikoissa. Lisäksi he käyttävät erilaisia entsymaattisia reaktioita muuttaakseen eri lähtöaineet eri tuotteiksi. Lisäksi nämä kaksi prosessia luovat erilaisia määriä ATP: tä. Aerobisessa hengityksessä Krebs-sykli seuraa glykolyysiä. Mutta anaerobisessa hengityksessä glykolyysi tapahtuu yksin.