Keskeinen ero kimeerin ja mosaiikin välillä on kunkin organismin muodostumiseen osallistuvien sygoottien lukumäärä. Erilaiset solupopulaatiot ovat peräisin kahdesta kimeeran sygootista, kun taas erilaiset solupopulaatiot ovat peräisin yhdestä mosaiikin sygootista.
Kimera ja mosaiikki olivat alun perin myyttisiä käsitteitä geneettisestä yhdistelmästä. Genetiikan ja molekyylibiologian kehittyessä on kuitenkin nyt mahdollista tieteellisesti selittää kimerismin ja mosaiikin ilmiöt. Sekä kimerismisessä että mosaiikissa joillakin kehon soluilla on erilainen genomi. Siten sama kudos voi sisältää kahta tai useampaa erilaista solupopulaatiota. Lisäksi kaksi sygoottia osallistuu kimeeraksi kehittyvän alkion muodostumiseen, kun taas yksi sygootti osallistuu mosaiikiksi kehittyvän alkion muodostumiseen. Varhaisen kehityksen mutaatio on syy mosaiikismiin, kun taas kahden eri zygootin osallistuminen on kimeerismin syy.
