Keskeinen ero Iso: n ja Sec: n välillä orgaanisessa kemiassa on, että käytämme termiä iso orgaanisen yhdisteen nimeämiseksi, joka sisältää kaikki hiiliatomit paitsi yhden muodostaen jatkuvan ketjun, kun taas termiä sec käytetään tunnistamaan funktionaalinen ryhmä, joka on sitoutunut sekundääriseen hiileen atomi.
Orgaanisessa kemiassa on monia etuliitteitä, joita käytämme tunnistamaan yhdisteissä läsnä olevat ryhmät ja nimeämään orgaaniset molekyylit niiden erottamiseksi toisistaan. Lisäksi parempi nimikkeistöjärjestelmä voi nimetä jopa hyvin monimutkaisen molekyylin. Esimerkki: IUPAC-nimikkeistö on paras nimikkeistöjärjestelmä, joka antaa jokaisen yksityiskohdan kemiallisen yhdisteen rakenteesta.
