Tärkein ero Golgi-kehojen ja Mitokondrioiden välillä on niiden suorittamassa toiminnassa. Golgi-kappaleiden (tai Golgi-laitteiden) päätehtävä on proteiinien muokkaaminen, lajittelu ja pakkaaminen eritystä varten, kun taas mitokondrioiden päätehtävä on solun energiavaluutan (ATP) tuottaminen hengityksen avulla.
Eukaryoottisolut sisältävät soluorganelleja, kuten Golgi-kappaleita, mitokondrioita, lysosomeja, ribosomeja, ytimiä jne. Nämä ovat solutoimintojen kannalta välttämättömiä elintärkeitä organelleja. Golgirungot ovat osa endomembraanijärjestelmää, joka koostuu rakkuloista ja taitetuista kalvoista, kun taas Mitokondriot ovat kaksoiskalvoon sitoutuneita pavunmuotoisia organelleja, joita löytyy eukaryoottisoluista.