Keskeinen ero mitokondrioiden ja kinetoplastin välillä on se, että mitokondriot ovat eukaryoottisia soluorganelleja, jotka tuottavat energiaa (ATP). Samaan aikaan kinetoplast on pyöreän DNA: n verkko, joka on läsnä suuren mitokondrion sisällä, erityisesti Kinetoplastea-luokan alkueläimissä.
Eukaryoottisoluilla on erityyppisiä soluorganelleja. Nämä erilaiset organellit suorittavat erilaisia toimintoja elävässä solussa. Näistä mitokondriot ovat yksi kalvoon sitoutuneista organelleista, jotka nähdään eukaryoottisolussa. Ne ovat organelleja, jotka vastaavat energian (ATP: n muodossa) tuotannosta soluissa. Siksi niitä pidetään solun voimalaitoksina. Mitokondrioilla on oma genomi, joka on pyöreä DNA, joka on peritty äidiltä. Kinetoplast on pyöreän DNA: n verkko, joka näkyy Kinetoplastida-luokkaan kuuluvien organismien suuressa mitokondriossa. Siksi kinetoplasteja nähdään vain tässä eukaryoottisessa aliverkkotunnuksessa.
