Tärkein ero apinan ja simpanssin välillä on se, että useimmilla apinalajeilla on pyrstö, kun simpansseilla ei ole häntä.
Apina ja simpanssi ovat kaksi kädellistä. Heillä on yhtäläisyyksiä ja eroja, vaikka ne kuuluvat samaan kädellisten ryhmään. Evoluutiomuodossa simpansseilla on kuitenkin enemmän läheisyyttä ihmisiin kuin apinoilla. Lisäksi kummankin eläimen suurempi aivokapasiteetti on tehnyt niistä erittäin älykkäitä ja tahdikkaita löytämään ruokaa ja suojaa elämään. Monekyn ja simpanssin välillä on kuitenkin selvä ero eri ominaisuuksien, kuten kehon muodon ja asentojen, suhteen.