Tärkein ero progressiivisen ja regressiivisen värjäyksen välillä on, että progressiivisessa värjäyksessä kudos jätetään värjäysliuokseen vain riittävän kauan halutun päätetapahtuman saavuttamiseksi, kun taas regressiivisessä värjäyksessä kudos jätetään tarkoituksellisesti ylivärjäykseen, kunnes väri kyllästää kaikki kudoselementit ja sitten tahraton.
Värjäys on tekniikka, joka korostaa ja erottaa kudoskomponentit ja tekee mahdolliseksi tarkkailla mikroskoopilla. H- ja E-värjäys on yleinen kudosvärjäysmenettely, jota käytetään yleisimmin histologiassa. Se käyttää hematoksyliiniä ja eosiinia (vastaväri). Ydinvärjäys hematoksyliinillä voidaan suorittaa progressiivisella tai regressiivisellä värjäystekniikalla. Joitakin hematoksyliinivalmisteita käytetään progressiiviseen värjäykseen. Mayerin hematoksyliini on yksi esimerkki. Progressiivisissa tahroissa on matala hematoksyliinipitoisuus. Siksi ne värjäävät hitaasti ja valikoivasti kromatiinin. Joitakin muita formulaatioita käytetään regressiivisessä värjäyksessä. Harris-hematoksyliinia käytetään regressiivisessä värjäyksessä. Regressiivisillä tahroilla on suuri hematoksyliinipitoisuus; siten tahra diffundoituu nopeasti koko solussa.
