Keskeinen ero ohimenevän ja tasapainoisen polymorfismin välillä perustuu alleelien käyttäytymiseen. Ohimenevä polymorfismi on geenin yhden alleelin asteittainen korvaaminen toisella alleelilla, kun taas tasapainotettu polymorfismi on geenin molempien kahden alleelin ylläpito ajan myötä
Geneettinen polymorfismi on yksi tai kaksi tai useampi tietyn DNA: n muunnos. Ohimenevä ja tasapainoinen polymorfismi ovat kahden tyyppisiä polymorfismeja, jotka syntyvät geenin kahden vaihtoehtoisen alleelin vuoksi. Ohimenevässä polymorfismissa tietyn lokuksen kahdesta vaihtoehtoisesta alleelista yksi alleeli korvataan asteittain toisella. Tasapainoisessa polymorfismissa nämä kaksi alleelia ovat tasapainossa toistensa kanssa. Molemmat geeniversiot säilyvät populaatiossa.