Keskeinen ero RP HPLC: n ja HIC: n välillä on se, että RP HPLC käyttää polaarisempaa liikkuvaa vaihetta ja vähemmän polaarista paikallaan olevaa vaihetta. HIC käyttää hydrofobista paikallaan olevaa faasia, joka antaa hydrofobisten molekyylien kiinnittyä siihen.
Kromatografia on analyyttinen tekniikka, joka auttaa erottamaan seoksen osiksi. Ensin meidän on liuotettava erotettava näyte liuokseen. Tätä liuos-aine-seosta kutsutaan liikkuvaksi faasiksi. Sitten liikkuva vaihe johdetaan toisen materiaalin, nimeltään kiinteä vaihe, läpi. Kiinteä vaihe määrittää komponenttien erotuksen. Erottelu tapahtuu materiaalin jakautumisen vuoksi liikkuvan vaiheen ja paikallaan olevan vaiheen välillä.