Keskeinen ero ionotrooppisten ja metabotrooppisten reseptorien välillä on se, että ionotrooppiset reseptorit mahdollistavat ionisten ligandien sitoutumisen niihin, mikä avaa ionikanavan. Samaan aikaan metabotrooppiset reseptorit mahdollistavat kemiallisten ligandien sitoutumisen reseptoreihin, aloittaen reaktioiden kaskadin kytkeytymällä G-proteiiniin.
Signaalinsiirto ja kalvonsiirto ovat tärkeitä prosesseja biologiassa. Molemmilla on tärkeä rooli aineenvaihdunnan säätelyssä järjestelmässä. Suurin osa metabolisista reiteistä ja membraanikuljetuksista tapahtuu reseptoreiden kautta, jotka sitoutuvat ligandeihin, jotka voivat olla joko ionisia ligandeja tai kemiallisia ligandeja.