Tärkein ero fotobiontin ja mykobiontin välillä on se, että fotobionti viittaa jäkälän fotosynteesikomponenttiin, joka on vihreä levä tai syanobakteeri, kun taas mykobionti viittaa jäkälän sienikomponenttiin, joka on pääasiassa ascomycete tai basidiomycete.
Elävien organismien välillä on erilaisia symbioottisia suhteita. Symbioottinen suhde on yhdistys, jossa kaksi erilaista organismilajia elää yhdessä. Lisäksi loisuus, keskinäisyys ja kommensalismi ovat kolmenlaisia symbioottisia suhteita. Keskinäisyys on hyödyllistä molemmille osapuolille. Jäkälä on sellainen keskinäinen assosiaatio, joka esiintyy levien / syanobakteerien ja sienen välillä. Tässä yhdistyksessä yksi osapuoli on vastuussa ruoan tuotannosta fotosynteesillä, kun taas toinen osapuoli on vastuussa veden imeytymisestä ja suojan tarjoamisesta. Tämän perusteella levä / syanobakteeri tunnetaan fotosynteesinä tekevänä fotobiontina, kun taas sieni tunnetaan mykobiontina, joka tarjoaa suojaa ja imee vettä.
