Keskeinen ero orgaanisen kemian ja epäorgaanisen kemian välillä on, että orgaaninen kemia on kemian ala, joka käsittelee orgaanisten yhdisteiden rakennetta, ominaisuuksia, reaktioita ja muita faktoja, kun taas epäorgaaninen kemia on epäorgaanisten yhdisteiden kemian ala.
Kemia on pohjimmiltaan tieteenala, joka koskee aineita, joista aine koostuu, niiden ominaisuuksien ja reaktioiden tutkimista sekä tällaisten reaktioiden käyttöä uusien aineiden muodostamiseksi. Kun sanomme "orgaaninen kemia", se käsittelee orgaanisia yhdisteitä, kun taas "epäorgaaninen kemia" käsittelee epäorgaanisia yhdisteitä.