Keskeinen ero komplementaaristen ja täydentävien geenien välillä on se, että komplementaariset geenit edellyttävät kunkin geenin läsnäoloa ominaisuuden ilmentämisessä, kun taas vain yksi geeni kahdesta täydentävästä geenistä vaatii toisen geenin läsnäoloa ominaisuuden ilmentämisessä.
Geenit ovat vuorovaikutuksessa keskenään tuottaessaan piirteen yksilössä. Nämä vuorovaikutukset ovat monimutkaisia ja tarvitsevat perusteellisen analyysin ymmärtääkseen, miten ne toimivat yhdessä, ja miten geenien läsnäolo vaikuttaa piirteiden ilmaisuun. Täydentävät ja täydentävät geenit ovat kaksi tällaista geenityyppiä, jotka ovat vuorovaikutuksessa toistensa kanssa tuottaessaan ominaisuutta. Ne osoittavat epistaattisia geenivuorovaikutuksia, mikä tarkoittaa, että yhden geenin vaikutus riippuu toisen geenin läsnäolosta.