Keskeinen ero substraatin ja aktiivisen kohdan välillä on se, että substraatti on kemiallinen yhdiste, joka voi käydä läpi kemiallisen reaktion, kun taas aktiivinen kohta on spesifinen alue entsyymissä.
Entsyymit ovat biologisia katalyyttejä. Nämä ovat proteiineja, jotka voivat vähentää kemiallisen reaktion aktivointienergiaa vähentääkseen reaktion energiaestettä. Siksi se voi lisätä reaktionopeutta. Reaktion reagenssi, johon entsyymit osallistuvat, on “substraatti”. Tämä substraatti sitoutuu entsyymin aktiiviseen kohtaan. Reaktiot tapahtuvat siellä. Lopulta se vapauttaa reaktion tuotteet.