Tärkein ero - vaaka- ja pystysuora geelielektroforeesi
Geelielektroforeesi on genetiikassa käytetty laboratoriotekniikka DNA: n, RNA: n ja muiden proteiinien sisältävien seosten erottamiseksi niiden varauksen ja molekyylikoon mukaan. DNA, RNA tai proteiinit, jotka on erotettava tällä menetelmällä, ajetaan pieniä huokosia sisältävän geelin läpi. Molekyylit ohjataan geelin läpi sähkökentällä. Molekyylit kulkevat geelin huokosten läpi, ja liikkeen nopeus on kääntäen verrannollinen niiden pituuksiin. Siksi molekyylit, joilla on pienempi molekyylikoko, liikkuvat nopeammin kuin molekyylit, joilla on suurempi molekyylipaino. Sähkökenttä syntyy geelin kahdessa päässä olevien varausten eroista. Yksi pää sisältää positiivisen varauksen ja toinen pää negatiivisen varauksen. Koska DNA- ja RNA-molekyylit ovat negatiivisesti varautuneita,ne houkuttelevat kohti geelin positiivisesti varautunutta päätä. Geelielektroforeesi voi olla kahta erilaista menetelmää: vaaka-geelielektroforeesi ja pystysuora geelielektroforeesi. Vaakasuorassa geelielektroforeesissa geeli on läsnä vaakasuorassa suunnassa ja upotetaan jatkuvaan juoksupuskuriin, joka on läsnä itse geelikotelon sisällä. Pystysuorassa geelielektroforeesissa puskurijärjestelmä on suunnattu pystysuoraan ja on epäjatkuva kahden kammion ollessa ylä- ja alapuolella katodin ja anodin kanssa, vastaavasti. Tämä on avainero vaaka- ja pystysuuntaisen geelielektroforeesin välillä.geeli on läsnä vaakasuunnassa ja upotetaan jatkuvaan juoksupuskuriin, joka on läsnä itse geelikotelon sisällä. Pystysuorassa geelielektroforeesissa puskurijärjestelmä on suunnattu pystysuoraan ja on epäjatkuva kahden kammion ollessa ylä- ja alapuolella katodin ja anodin kanssa, vastaavasti. Tämä on avainero vaaka- ja pystysuuntaisen geelielektroforeesin välillä.geeli on läsnä vaakasuunnassa ja upotetaan jatkuvaan juoksupuskuriin, joka on läsnä itse geelikotelon sisällä. Pystysuorassa geelielektroforeesissa puskurijärjestelmä on suunnattu pystysuoraan ja on epäjatkuva kahden kammion ollessa ylä- ja alapuolella katodin ja anodin kanssa, vastaavasti. Tämä on avainero vaaka- ja pystysuuntaisen geelielektroforeesin välillä.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on vaakasuora geelielektroforeesi
3. Mikä on pystysuora geelielektroforeesi
4. Vaakasuoran ja pystysuoran geelielektroforeesin yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - vaaka- ja pystysuora geelielektroforeesi taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mikä on vaakasuora geelielektroforeesi?
Vaakasuora geelielektroforeesi käyttää perusteoriaa DNA-, RNA- tai proteiinimolekyylien erottamiseen niiden molekyylikoon ja varauksen mukaan. Tässä tekniikassa geeli on läsnä vaakasuunnassa ja upotetaan jatkuvaan puskuriin. Agaroosigeeliä käytetään erottamaan geelikotelo kahteen osastoon. Geelikotelon toinen pää sisältää anodin, kun taas toinen pää sisältää katodin. Kun virtaa käytetään, tässä tekniikassa käytetty puskuri sallii varausgradientin luomisen. Kun lataus pannaan, geeli pyrkii kuumenemaan. Puskuri toimii myös jäähdytysnesteenä, joka pitää lämpötilan optimaalisella tasolla. Juoksevan puskurin uudelleenkierto estää pH-gradientin muodostumisen. Epäjatkuvaa puskurijärjestelmää ei voida käyttää horisontaalisessa geelielektroforeesissa, koska geelijärjestelmän kaksi osastoa kytkeytyvät käynnissä olevaan puskuriin. Akryyliamidia käytetään geelielektroforeesissa proteiiniseosten erottamiseksi.
Kuva 01: Vaakasuora geelielektroforeesi
Vaakasuorassa geelielektroforeesissa akryyliamidia ei voida käyttää, koska geelikotelo altistetaan hapelle. Hapen läsnäolon vuoksi akryyliamidin polymerointi estyy, mikä häiritsee geelin muodostumista. Vaakasuora geelielektroforeesi on vaivaton menetelmä, jota käytetään DNA: n ja RNA: n erottamiseen.
Mikä on pystysuora geelielektroforeesi?
Pystysuora geelielektroforeesitekniikka toimii geelielektroforeesin ensisijaisen teorian mukaisesti, mutta sen katsotaan olevan monimutkaisempi kuin vaaka-geelielektroforeesimenetelmä. Tässä tekniikassa käytetään epäjatkuvaa puskuria. Katodi sijaitsee yläkammiossa ja anodi alakammiossa. Kussakin osastossa olevat elektrodit tarjoavat tarvittavan sähkökentän. Ohut kerros geeliä kaadetaan kahden asennetun lasilevyn väliin. Siksi geelin yläosa upotetaan ylempään kammioon ja geelin alaosa upotetaan alaosassa olevaan kammioon. Kun virta on syötetty, pieni osa puskurista siirtyy alakammioon yläkammiosta geelin läpi. Tässä tekniikassa käytetty virta on minuuttiyksikköä.
Kuva 02: Pystysuora geelielektroforeesi
Pystysuorassa geelielektroforeesissa puskuri virtaa vain geelin läpi. Tämä mahdollistaa jännitteen gradientin tarkan hallinnan erotusvaiheessa. Akryyliamidigeeliä voidaan käyttää, koska osastot eivät ole alttiina ilmakehän hapelle. Akryyliamidigeelin pienemmän huokoskokon ansiosta tarkka erottaminen voidaan saavuttaa suuremmalla resoluutiolla.
Mitkä ovat yhtäläisyydet vaaka- ja pystysuoran geelielektroforeesin välillä?
- Molemmat järjestelmät toimivat geelielektroforeesin perusteorian mukaisesti.
- Anodia ja katodia käytetään tarvittavan sähkökentän tuottamiseen molemmissa järjestelmissä.
Mikä on ero vaaka- ja pystysuoran geelielektroforeesin välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Vaaka- ja pystysuora geelielektroforeesi |
|
| Vaakasuora geelielektroforeesi on geelielektroforeesitekniikka, jossa geeli on läsnä vaakasuunnassa. | Pystysuora geelielektroforeesi on geelielektroforeesitekniikka, jossa geeli on suunnattu pystysuoraan. |
| Puskuri | |
| Vaakasuora geelielektroforeesi koostuu jatkuvasta puskurista. | Juoksupuskuri on epäjatkuva vertikaaligeelielektroforeesissa. |
| Akryyliamidin käyttö | |
| Akryyliamidia ei voida käyttää horisontaaliseen geelielektroforeesiin, koska geelilaatikko altistetaan ilmakehän hapelle. | Koska geeliä ei altisteta ilmakehän hapelle kahden erillisen kammion takia, akryyliamidia voitaisiin käyttää vertikaaliseen geelielektroforeesiin. |
| Toiminto | |
| Horisontaalista geelielektroforeesia käytetään useammin DNA- ja RNA-seosten, mutta ei proteiinien erottamiseen. | Vertikaalista geelielektroforeesia käytetään proteiiniseosten erottamiseen. |
Yhteenveto - Vaakasuora vs pystysuora geelielektroforeesi
Geelielektroforeesi on laboratoriotekniikka, jota käytetään laajalti DNA: n, RNA: n ja proteiinien molekyylejä sisältävien seosten erottamisessa. Geelielektroforeesissa on kaksi menetelmää: vaaka- ja pystysuora geelielektroforeesi. Vaakasuorassa geelielektroforeesissa juoksupuskuri on jatkuvaa, kun taas pystysuorassa geelielektroforeesissa se on epäjatkuvaa. Tämä on ero vaaka- ja pystysuoran geelielektroforeesin välillä. Molemmat järjestelmät toimivat geelielektroforeesin yleisen periaatteen mukaisesti.
Lataa PDF-versio vaaka- ja pystysuorasta geelielektroforeesista
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainausviestin mukaan. Lataa PDF-versio täältä Ero vaaka- ja pystysuoran geelielektroforeesin välillä.
