Tärkein ero - geelielektroforeesi vs. SDS-sivu
Geelielektroforeesi on tekniikka, joka erottaa makromolekyylit sähkökentässä. Molekyylibiologiassa on yleinen menetelmä erottaa DNA, RNA ja proteiinit seoksista niiden molekyylikoon mukaan. SDS Page on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään erottamaan proteiinit proteiiniseoksesta niiden koon perusteella. Geelielektroforeesi on termi, jota käytetään viittaamaan normaaliin tekniikkaan, jota käytetään DNA: n, RNA: n ja proteiinien erottamiseen, kun taas SDS Page on yksi geelielektroforeesityyppi. Tämä on avainero geelielektroforeesin ja SDS-sivun välillä.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja tärkein ero
2. Mikä on geelielektroforeesi
3. Mikä on SDS-sivu
4. Vertailu rinnakkain - geelielektroforeesi vs. SDS-sivu
5. Yhteenveto
Mikä on geelielektroforeesi?
Geeli-elektroforeesi on laboratorioissa käytetty yleinen tekniikka varattujen molekyylien, kuten DNA, RNA, proteiinit, jne. Erottamiseksi niiden seoksista. Geeliä käytetään geelielektroforeesissa. Se toimii molekyyliseulana. Geelielektroforeesissa käytetään kahta tyyppiä geelejä, nimittäin agaroosi ja polyakryyliamidi. Geelin valinta ja geelivalmiste ovat tärkeitä tekijöitä, jotka on otettava huomioon geelielektroforeeseissa, koska geelin huokoskokoa tulisi käsitellä huolellisesti molekyylien hyvän erottamisen varmistamiseksi geelielektroforeesin avulla. Geelielektroforeesissa on sähkökenttä, joka on kytketty geelin kahteen päähän. Geelin toisessa päässä on positiivinen varaus, kun taas toisessa päässä on negatiivinen varaus.
DNA ja RNA ovat negatiivisesti varautuneita molekyylejä. Kun ne on ladattu geeliin geelin negatiivisesta päästä ja kohdistettu sähkökentälle, ne kulkeutuvat geelihuokosien läpi kohti geelin positiivisesti varautunutta päätä. Migraation nopeus riippuu varauksesta ja molekyylin koosta. Pienemmät molekyylit kulkeutuvat helposti geelihuokosten läpi kuin suuremmat molekyylit. Siksi pienemmät molekyylit kulkevat pitkän matkan geelin läpi ja suuremmat molekyylit lyhyen matkan. Molekyylien liikkumisen havaitsemiseksi geelillä käytetään erityyppisiä väriaineita. Sähkökenttää käytetään tietyn ajanjakson ajan ja se pysäytetään molekyylien menetyksen estämiseksi ja molekyylien pitämiseksi kuljetuissa paikoissa. Geelissä voidaan havaita erilaisia nauhoja. Nämä kaistat edustavat erikokoisia molekyylejä. Siten,geelielektroforeesi on hyödyllinen molekyylien erottamiseksi niiden koon mukaan.
Geelielektroforeesi sisällytetään molekyylibiologian eri tekniikoihin preparatiivisena tekniikkana, kuten PCR, RFLP, kloonaus, DNA-sekvensointi, Southern blotting, genomikartoitus jne.
Kuva 01: Agaroosigeelielektroforeesi
Mikä on käyttöturvallisuustiedotteen sivu?
Natriumdodekyylisulfaattipolyakryyliamidigeelielektroforeesi (SDS-sivu) on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään proteiinien erottamiseen. Kun geelielektroforeesia käytetään proteiinien erottamiseen, tarvitaan erityishoitoja, koska proteiinit eivät ole negatiivisesti varautuneita, kuten DNA ja RNA, eivätkä ne kulkeudu kohti positiivista tai negatiivista päätä. Näin ollen proteiinit denaturoidaan ja päällystetään negatiivisella varauksella ennen geelielektroforeesia. Se tehdään käyttämällä pesuainetta nimeltä natriumdodekyylisulfaatti (SDS). Geelielektroforeesi, joka käyttää SDS: ää ja polyakryyliamidigeeliä kantaja-aineeksi, tunnetaan nimellä SDS Page. Tätä tekniikkaa käytetään yleisesti biokemiassa, genetiikassa, rikosteknologiassa ja molekyylibiologiassa.
SDS-sivun aikana proteiinit sekoitetaan SDS: n kanssa. SDS avaa proteiinit lineaariseen muotoon ja päällystää ne negatiivisella varauksella, joka on verrannollinen niiden molekyylimassaan. Negatiivisen varauksen vuoksi proteiinimolekyylit kulkeutuvat kohti geelin positiivista varauspäätä ja erottuvat molekyylimassansa mukaan. SDS-sivulla polyakryyliamidia käytetään kiinteänä kantajana geelille. Proteiinien varsinainen erottaminen riippuu pääasiassa geelin ominaisuuksista. Siksi polyakryyliamidigeelivalmistelut tulisi tehdä huolellisesti ja käyttää oikeita polyakryyliamidipitoisuuksia. Polyakryyliamidigeeleillä on korkea resoluutio kuin agaroosigeeleillä. Siksi SDS-sivua pidetään korkean resoluution tekniikkana proteiinien erottamiseksi.
SDS Page on eräänlainen denaturoiva geelielektroforeesi. Sillä on merkittävä rajoitus proteiinianalyysissä. Koska SDS denaturoi proteiinit ennen erottamista, se ei salli entsymaattisen aktiivisuuden, proteiineihin sitoutumisvuorovaikutusten, proteiinikofaktorien jne.
Kuva 02: KTT-sivu
Mitä eroa on geelielektroforeesilla ja SDS-sivulla?
Geelielektroforeesi vs. SDS - sivu |
|
| Geelielektroforeesi on menetelmä makromolekyylien erottamiseksi sähkökenttää käyttämällä. | SDS Page on korkean resoluution geelielektroforeesitekniikka, jota käytetään erottamaan proteiinit niiden massan perusteella. |
| Gel Run | |
| Se voidaan suorittaa vaaka- tai pystysuunnassa. | SDS-sivu toimii aina pystysuunnassa. |
| Erottamisen perusta | |
| Erotus tapahtuu varauksen ja koon mukaan. | Proteiinierotus tapahtuu massan ja varauksen mukaan. |
| Resoluutio | |
| Agaroosigeelielektroforeesilla on matala resoluutio ja polyakryyliamidigeelielektroforeesilla on suurempi resoluutio | SDS-sivulla on parempi resoluutio. |
| Denaturoituminen | |
| Geelielektroforeesi sisältää sekä denaturointi- että ei-denaturointitekniikat. | SDS-sivu denaturoi proteiinit ennen erottamista. |
Yhteenveto - geelielektroforeesi vs. SDS-sivu
Geelielektroforeesi on yleinen tekniikka, jota käytetään DNA: n, RNA: n ja proteiinien erottamiseen ja analysointiin niiden koon ja varauksen perusteella. Geelielektroforeesia on kaksi päätyyppiä, nimittäin agaroosigeelielektroforeesi ja polyakryyliamidigeelielektroforeesi. Agaroosigeelejä käytetään pääasiassa nukleiinihappojen erottamiseen; kun vaaditaan suurempaa resoluutiota, käytetään polyakryyliamidigeelejä. SDS Page on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään yleisesti erilaisten proteiiniseosten erottamiseen. Sitä pidetään korkean resoluution proteiinierotustekniikkana. Tämä on ero geelielektroforeesin ja SDS-sivun välillä.
