Tärkein ero - DNA-ligaasi vs. DNA-polymeraasi
DNA-ligaasi ja DNA-polymeraasi ovat tärkeitä entsyymejä, jotka osallistuvat organismien DNA-replikaatioon ja DNA-korjausmekanismeihin. DNA-ligaasi on vastuussa DNA-fragmenttien liittämisestä katalysoimalla fosfodiesterisidosten muodostumista nukleotidien välillä. DNA-polymeraasi on vastuussa DNA: n synteesistä rakennuspalikoistaan (nukleotideista) käyttämällä templaatti-DNA: ta. Tämä on keskeinen ero DNA-ligaasin ja DNA-polymeraasin välillä.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on DNA-ligaasi
3. Mikä on DNA-polymeraasi
4. Vertailu vierekkäin - DNA-ligaasi vs. DNA-polymeraasi
5. Yhteenveto
Mikä on DNA-ligaasi?
DNA-ligaasi on entsyymi, joka katalysoi muodostumista fosfodiesterisidoksen välillä 3' - OH ja 5'-PO 4 nukleotidien ryhmät ja niiden liittäminen helpottuu DNA-fragmentteja. Se tunnetaan myös molekyylitikina. Tämä kyky mahdollistaa DNA-aukkojen tai kolojen täyttämisen ja DNA-replikaation aikana muodostuneiden Okazaki-fragmenttien liittämisen. DNA-ligaasit ovat erittäin hyödyllisiä rekombinantti-DNA-tekniikassa rekombinantti-DNA-molekyylien tuottamiseksi. DNA-ligaasi yhdistää mielenkiinnon kohteena olevan DNA: n vektori-DNA: n kanssa. Siksi se on tärkeä entsyymi organismeille.
DNA-ligaasientsyymi riippuu sen toiminnasta kofaktorista ja Mg2 + -ioneista. DNA-ligaaseissa on kaksi kofaktoria. NAD + toimii bakteerien DNA-ligaasien kofaktorina, kun taas ATP toimii usein kofaktoriviruksena ja eukaryoottisina DNA-ligaaseina. Eukaryoottinen DNA-ligaasitoiminta täydentyy kolmen päävaiheen kautta.
Vaihe 01. DNA-ligaasi hyökkää ATP-molekyyliin ja vapauttaa pyrofosfaattia (kaksi fosfaattiryhmää) ja AMP: tä ja muodostaa ligaasi-adenylaattivälituotteen sitoutumalla kovalenttisesti saatuun AMP: hen.
Vaihe 02: Muodostunut entsyymi AMP-välituote siirtää AMP: n 5'-fosfaattiin ja muodostaa DNA: n - adenylaatin (DNA-juosteen 5'-fosfaattihappi hyökkää ligaasi-adenylaatti-välituotteen fosforia vastaan).
Vaihe 03: DNA-ligaasi katalysoi lempin 3'-OH: n hyökkäyksen DNA-adenylaattiin liittyäkseen polynukleotideihin ja vapauttaa AMP: tä.
DNA-ligaasit eristetään yleensä T4-bakteriofagista ja niitä käytetään laajasti rekombinantti-DNA-tekniikassa.
Kuva 01: DNA-ligaasi lempikorjauksessa
Mikä on DNA-polymeraasi?
DNA-polymeraasi on läsnä oleva entsyymi, jota esiintyy kaikissa organismeissa, jotka osallistuvat DNA-synteesiin ja genomin replikaatioon. Geneettiset tiedot siirtyvät vanhemmilta jälkeläisille DNA-polymeraasien avulla. Se katalysoi uuden DNA: n synteesiä olemassa olevalle DNA: lle. DNA-polymeraasi lisää nukleotidit (nukleiinihappojen rakennuspalikat) alukesekvenssin 3'-OH-ryhmään ja jatkaa juosteen muodostumista 5'-suuntaan. Suurimmalla osalla DNA-polymeraaseista on 5 '- 3' polymeraasiaktiivisuutta ja 3 '- 5' eksonukleaasiaktiivisuutta oikolukemiseen.
Prokaryoottisia DNA-polymeraaseja kuvataan viidessä pääryhmässä. Eukaryootit sisältävät vähintään 16 erilaista DNA-polymeraasia. Kaikki nämä DNA-polymeraasit on ryhmitelty seitsemään perheeseen, nimittäin A, B, C, D, X, Y ja RT (käänteistranskriptaasi).
Kuva 02: DNA-polymeraasipohjainen DNA-replikaatio
Mitä eroa on DNA-ligaasilla ja DNA-polymeraasilla?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
DNA-ligaasi vs. DNA-polymeraasi |
|
DNA-ligaasi on entsyymi, joka katalysoi fosfodiesterisidosten muodostumista nukleotidien välillä ja yhdistää DNA-fragmentit yhteen. | DNA-polymeraasi on entsyymi, joka katalysoi DNA: n synteesiä nukleotideja käyttäen. |
Rooli DNA-replikaatiossa | |
DNA-ligaasi on lisäentsyymi DNA-replikaatiossa, joka yhdistää Okazaki-fragmentit. | DNA-polymeraasi on tärkein entsyymi DNA-replikaatiossa. |
Vaatimukset | |
Se riippuu Mg 2+ -ioneista ja ATP / NAD + -kofaktoreista | Se riippuu templaatista, nukleotideista, alukkeista ja Mg 2+: sta. |
Toiminnot | |
DNA-ligaasi on tärkeä DNA-rekombinaatiossa, DNA-korjauksessa ja DNA-replikaatiossa. | DNA-polymeraasi on tärkeä DNA-replikaation, DNA-korjauksen ja DNA-rekombinaatiotekniikan kannalta. |
Yhteenveto - DNA-ligaasi vs. DNA-polymeraasi
DNA-ligaasi on tärkeä entsyymi, jota tarvitaan DNA-fragmenttien liittämiseen fosfodiesterisidoksilla. DNA-polymeraasi on tärkein uuden DNA-synteesin kannalta tärkeä entsyymi. Tärkein ero DNA-ligaasin ja DNA-polymeraasin välillä on niiden toiminta. Molemmat entsyymit ovat kuitenkin välttämättömiä DNA: n korjaamiseksi, DNA-replikaatiolle ja rekombinantti-DNA-tekniikalle.