Tärkein ero Punnett-neliön ja sukutaulun välillä on se, että Punnett-neliö näyttää kaikki mahdolliset genotyypit, jotka voidaan periä kahdesta vanhempien genotyypistä, kun taas sukutaulu edustaa tietyn piirteen sukuhistoriaa, erityisesti geenin perintöä.
Punnettin neliö ja sukutaulu ovat kahden tyyppisiä työkaluja, jotka auttavat määrittämään geenien perinnöllisyyden todennäköisyyden. Molemmat osoittavat todennäköisyyden periä tietty ominaisuus jälkeläisille. Toisin sanoen, molemmat ennustavat perintömallit perheen linjoilla. Näin ollen ne voivat auttaa määrittämään lapsen perinnöllisen sairauden riskin. Punnett-neliö on yksinkertaisesti graafinen tapa näyttää kaikki mahdolliset genotyypit, joita voi esiintyä kahden vanhemman lapsilla.