Tärkein ero lippulaiva- ja sateenvarjolajien välillä on se, että lippulaiva on laji, joka toimii symbolina tai kuvakkeena määritellylle luontotyypille, kun taas sateenvarjolaji on laji, joka osallistuu epäsuorasti monien muiden lajien suojeluun ekosysteemin tai maiseman tasolla.
Ekosysteemissä on erityyppisiä eläviä organismeja. Nämä lajit ovat vuorovaikutuksessa erityyppisten prosessien, kuten saalistuksen, loisumisen, keskinäisyyden, symbioosin ja kilpailun kautta. Lajien suojelu voi olla subjektiivista, eikä lajien tilan määrittäminen ole helppoa. Siksi säilyttämisen helpottamiseksi voidaan käyttää joitain lajeja, kuten sateenvarjo-, peilikivilajeja ja lippulaivalajeja. Näiden lajien muutokset osoittavat muiden lajien tilan ekosysteemissä. Siksi se helpottaa suojelupäätöksiä.
