Tärkein ero proteiinikinaasi A: n ja proteiinikinaasi C: n välillä on se, että proteiinikinaasi A on proteiinikinaasityyppi, joka on riippuvainen syklisestä AMP: stä, kun taas proteiinikinaasi C on proteiinikinaasien alaryhmä, joka reagoi lipidisignaaleihin.
Kinaasi on entsyymi, joka katalysoi fosfaattiryhmän siirtymistä korkean energian, fosfaattia luovuttavista molekyyleistä spesifisiin substraatteihin. Kutsumme tätä prosessia fosforylaatioksi. Kinaasit säätelevät suurinta osaa solureiteistä, mukaan lukien signaalinsiirto. Proteiinikinaasit ovat tietyntyyppisiä kinaaseja, jotka katalysoivat proteiinin fosforylaatiota tai siirtävät fosfaattia tarkkoihin substraattiproteiineihin. Nämä entsyymit säätelevät proteiinien biologista aktiivisuutta fosforyloimalla spesifisiä aminohappoja ATP: n fosfaattiryhmillä. Kun fosforylaatio tapahtuu, passiiviset proteiinit muuttuvat aktiivisiksi proteiineiksi konformaation muutoksen vuoksi. Proteiinikinaasi C ja proteiinikinaasi A ovat kahden tyyppisiä proteiinikinaasiperheitä, jotka kuuluvat alaperheeseen: proteiinikinaasien AGC-kinaasi.