Tärkein ero protomeerien ja kapselomeerien välillä on se, että protomeerit ovat oligomeeristen proteiinien rakenteellisia yksiköitä, kun taas kapselomeerit ovat yksittäisiä proteiineja, jotka koostuvat protomeereistä, jotka ovat viruksen kapsidin rakenteellisia alayksiköitä.
Virus on solunsisäinen pakollinen loinen, joka on tarttuva partikkeli. Kapsid on yksi viruspartikkelin kahdesta pääkomponentista. Se on proteiinipäällyste, joka ympäröi ja suojaa viruksen genomia. Kapsiidi koostuu protomeereistä, jotka ovat oligomeeristen proteiinien rakenteellisia yksiköitä. Kapsomeeri on viruksen kapsidin rakenteellinen alayksikkö, ja se on useiden protomeerien aggregaatio yhtenä yksikkönä. Siten protomeerit koottavat itsensä muodostamaan kapso- meerin ja kapselit muodostuvat itsestään muodostamaan kapsidin.
