Tärkein ero - RNASE A vs. RNASE H
Ribonukleaasit ovat nukleaaseja, jotka hajottavat spesifisesti RNA: n pienemmiksi yksiköiksi. Ne voidaan jakaa kahteen luokkaan; endoribonukleaasit ja eksoribonukleaasit. Endoribonukleaasi on endonukleaasi, joka voi joko hajottaa yksijuosteisen tai kaksijuosteisen RNA: n. Se katkaisee fosfodiesterisidokset RNA-polynukleotidiketjussa. Esimerkkejä ovat RNaasi A, RNaasi III, RNaasi T1, RNaasi P ja RNaasi H. Exoribonukleaasi on eksonukleaasi, joka hajosi RNA: n poistamalla terminaaliset nukleotidit RNA-molekyylin joko 5'- tai 3'-päästä. Esimerkkejä ovat RNaasi R, RNaasi II, RNaasi D ja RNaasi PH. Keskeinen ero RNASE A: n ja RNASE H: n välillä on, että RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka hajottaa spesifisesti yksijuosteisen RNA: n pienemmiksi komponenteiksi, kun taas RNaasi H on epäspesifinen entsyymi, joka pilkkää RNA-DNA-hybridin RNA: n pienempiin yksiköihin hydrolyyttinen mekanismi.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on RNASE A
3. Mikä on RNASE H
4. RNASE A: n ja RNASE H: n yhtäläisyydet
5. Vertailu vierekkäin - RNASE A vs RNASE H taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mikä on RNASE A?
RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka katkaisee spesifisesti parittomat sytosiini- ja urasiilitähteet yksijuosteisen RNA: n 3'-päässä. RNaasi H toimii korkeammalla suolapitoisuudella (0,3 M tai suurempi NaCl-pitoisuus). Hydrolyyttinen reaktio on kaksi vaihetta. Se muodostaa 3'-fosforyloidun tuotteen 2 ', 3'-syklisen monofosfaattivälituotteen kautta. Vaikka se on spesifinen yksisäikeiselle RNA: lle korkeammalla suolakonsentraatiolla, se voi myös hajottaa kaksisäikeisen RNA: n ja RNA: n RNA-DNA-hybridissä pienemmällä NaCl-konsentraatiolla (alle 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield syntetisoi ensin tämän entsyymin. RNaasi A on erittäin suosittu entsyymi molekyylitutkimuksessa. Naudan haiman RNaasi A on esimerkki RNaasi A: sta. Ja se on yksi vaikeimmista entsyymeistä, joita käytetään laboratoriossa. Tämä entsyymi ei tarvitse aktiivisuuttaan kofaktoria. Se on erittäin lämpöstabiili entsyymi. RNaasi A on ensimmäinen entsyymi ja kolmas proteiini, jolle todettiin oikea aminohapposekvenssi. Tämä entsyymi on hyvin pieni, ja siinä on 124 aminohappoa ja molekyylipaino 12600da. Ja siinä on neljä histidiinitähdettä (Hänen 12 ja Hänen 119, jotka osallistuvat katalyyttiseen reaktioon).
Kuva 01: RNaasi A
RNaasi A voidaan eristää keittämällä raakanäyte. Kun kiehuu, kaikki muut entsyymit hajottavat jäljellä olevan RNaasi A: n. RNaasi A on hämmästyttävän stabiili entsyymi. Tämä entsyymi estää ribonukleaasinestäjäproteiinin, raskasmetalli- ja uridiinivanadaattikomplekseja.
Mikä on RNaasi H?
RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion kautta. RNaasi H katkaisee RNA: n 3'-OP-sidoksen RNA-DNA-hybridissä. Viime kädessä se tuottaa 3'OH- ja 5'-fosfaattipäätteisiä tuotteita. DNA-replikaatiossa sillä on keskeinen rooli poistamalla RNA-aluke uusien DNA-säikeiden muodostumisen jälkeen. Laboratorio-olosuhteissa se hajottaa spesifisesti RNA: ta RNA-DNA-hybridissä, mutta ei DNA: ta ja hybridisoitumatonta RNA: ta. Ja tätä entsyymiä käytetään yleensä RNA-templaatin tuhoamiseen sen jälkeen, kun ensimmäinen komplementaarinen DNA-juoste on muodostunut cDNA-synteesin aikana.
Kuva 02: RNaasi H
RNaasi H: ta käytetään myös nukleaasisuojausmäärityksissä. Se voidaan myös sisällyttää poly A-hännän poistamiseen mRNA: sta. RNaasi H pystyy tuhoamaan ei-koodaavan RNA: n solun sisällä ja ulkopuolella. Metalli-ioneja tarvitaan kofaktoreina tälle proteiiniaktiivisuudelle. Kelaattoria (EDTA) voidaan käyttää RNaasi H -entsyymin estämiseen.
Mitä yhtäläisyyksiä RNASE A: n ja RNASE H: n välillä on?
- Molemmat ovat luonteeltaan proteiineja.
- Molemmat ovat endoribonukleaasia
- Molemmat voivat hajottaa RNA: ta.
- Molemmat suorittavat hydrolyyttisiä reaktioita.
- Molemmat laboratoriot käyttävät näitä molempia.
Mikä on ero RNASE A: n ja RNASE H: n välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
RNASE A vs. RNASE H |
|
| RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka katkaisee spesifisesti parittamattomien sytosiini- ja urasiilijäämien 3'-pään yksijuosteisen RNA: n korkeammalla suolakonsentraatiolla. | RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion kautta. |
| RNA-pilkkomisen luonne | |
| RNaasi A katkaisee yksisäikeisen RNA: n korkeammalla suolakonsentraatiolla. | RNaasi H katkaisee RNA: n RNA-DNA-hybridissä. |
| Aktiviteettikertoimien tarve | |
| RNaasi A ei tarvitse kofaktoreita toimintaansa. | RNaasi H tarvitsee metalli-ioneja kofaktoreina toimintaansa. |
| Proteiiniaktiivisuuden estäjät | |
| Ribonukleaasin estäjäproteiini, raskasmetalli- ja uridiinivanadaattikompleksit estävät RNAse A -aktiivisuutta. | Kelaattori (EDTA) estää RNaasi H: n aktiivisuutta. |
| RNA-alukkeen poisto DNA-replikaatiossa | |
| RNaasia A ei käytetä RNA-alukkeiden poistamiseen DNA-replikaatiossa. | RNaasia H käytetään RNA-alukkeiden poistamiseen DNA-replikaatiossa |
| DNA-mallin poisto täydentävän DNA: n (C-DNA) synteesissä | |
| RNaasia A ei käytetä RNA-templaatin poistamiseen komplementaarisen DNA: n (C-DNA) synteesin aikana. | RNaasia H käytetään RNA-templaatin poistamiseen komplementaarisen DNA: n (C-DNA) synteesin aikana. |
| Poly-A-hännän poisto mRNA: ssa, joka on hybridisoitu Oligoon (dt) | |
| RNaasia A ei käytetä”poly-A-hännän” poistamiseen mRNA: sta, joka on hybridisoitu oligoon (dt). | RNaasi H: ta käytetään poistamaan”poly-A-pyrstö” mRNA: sta, joka on hybridisoitu oligoon (dt) |
Yhteenveto - RNASE A vs. RNASE H
Ribonukleaasit ovat nukleaasientsyymejä, joilla on kyky pilkkoa RNA pienempiin yksiköihin. Ne ovat kahta tyyppiä; endoribonukleaasit ja eksoribonukleaasit. Endoribonukleaasi on endonukleaasi, jolla on kyky hajottaa yksijuosteinen tai kaksijuosteinen RNA. Ja se katkaisee fosfodiesterisidoksen RNA-polynukleotidiketjussa. RNaasi A ja RNaasi H ovat kaksi endoribonukleaasia. RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka katkaisee spesifisesti parittomat sytosiini- ja urasiilijäännökset yksijuosteisen RNA: n 3'-päässä korkeammalla suolakonsentraatiolla. RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion kautta. Tämä on ero RNaasi A: n ja RNaasi H: n välillä.
Lataa PDF-tiedosto RNASE A vs RNASE H
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainausviestin mukaan. Lataa PDF-versio täältä Ero RNASE A: n ja RNASE H: n välillä
