Keskeinen ero kloonausvektorin ja ekspressiovektorin välillä on se, että kloonausvektori kuljettaa vieraan DNA-fragmentin isäntäsoluun, kun taas ekspressiovektori helpottaa geenien ilmentymistä proteiineiksi.
Vektori on tärkeä termi molekyylibiologiassa. Rekombinantti-DNA-tekniikassa vektorin päärooli on tarjota kuljetusmuoto käyttökelpoiseen isäntäsoluun insertoitavaan DNA-fraktioon. Lisäksi se on DNA-molekyyli, jota käytetään viemään vieras DNA-fragmentti keinotekoisesti isäntäsoluun ekspressoitavaksi tai replikoitavaksi. Eniten käytettyjä vektoreita ovat plasmidit, virusvektorit, kosmidit ja keinotekoiset kromosomit. Kloonausvektori ja ekspressiovektori ovat kahden tyyppisiä vektoreita, jotka on luokiteltu niiden sovellusten perusteella.