Keskeinen ero perustajavaikutuksen ja geneettisen driftin välillä on se, että perustajavaikutus on geneettisen ajautumisen tapahtuma, jossa pieni ryhmä jakautuu pääväestöstä perustamaan siirtomaa, kun taas geneettinen ajautuminen viittaa alleelitaajuuksien satunnaisiin muutoksiin pienissä populaatioissa, jotka aiheuttavat tiettyjen geenien katoaminen ajan myötä.
Evoluutio on prosessi, joka selittää organismien ominaisuuksien muutoksen peräkkäisten sukupolvien aikana. Evoluutio perustuu luonnolliseen valintaan ja geneettiseen ajautumiseen. Luonnollisen valinnan vuoksi populaatioissa säilyy suotuisia ominaisuuksia, kun taas epäsuotuisat ominaisuudet vähenevät populaatioista ajan myötä. Vastaavasti geneettinen ajelehtiminen aiheuttaa satunnaisia muutoksia alleelitaajuuksissa pienissä populaatioissa johtuen tiettyjen geenien mahdollisesta katoamisesta kuoleman tai lisääntymisen välttämisen vuoksi. Perustajavaikutus ja pullonkaulavaikutus ovat kaksi geneettisen ajautumisen tapahtumaa.
