Keskeinen ero elektronegatiivisuuden ja ionisaatioenergian välillä on, että elektronegatiivisuus selittää elektronien vetovoiman, kun taas ionisaatioenergia viittaa elektronien poistamiseen atomista.
Atomit ovat kaikkien olemassa olevien aineiden rakennuspalikoita. Ne ovat niin pieniä, että emme voi edes tarkkailla niitä paljaalla silmällä. Atomi koostuu ytimestä, jossa on protoneja ja neutroneja. Neutronien ja positronien lisäksi ytimessä on muita pieniä subatomisia hiukkasia, ja kiertoradoilla on elektronia. Protonien läsnäolon vuoksi atomituumilla on positiivinen varaus. Ulkopallon elektronilla on negatiivinen varaus. Täten atomin positiivisten ja negatiivisten varausten väliset vetovoimat ylläpitävät sen rakennetta.