Tärkein ero endoparasiittien ja ektoparasiittien välillä on se, että endoparasiitit ovat loisorganismeja, jotka elävät isäntäorganismin sisällä, kun taas ektoparasiitit ovat loisorganismeja, jotka elävät isännän ulkopuolella, lähinnä iholla.
Loinen on organismi, joka elää toisessa organismissa, joka tunnetaan isäntänä. Loinen saa ravintoaineita isännältä. Parasitismi on suhde isännän ja loisen välillä. Loiset ovat aina riippuvaisia isännästä, eivätkä ne voi elää ilman isäntää. Tämä suhde on haitallinen isännälle, mutta se on hyödyllinen loiselle. Tämä voi aiheuttaa isännille vakavia sairauksia. Joskus loiset voivat jopa tappaa isännän. Monilla loisilla on monimutkaiset elinkaaret, jotka tarvitsevat useita isäntiä kasvuun ja lisääntymiseen. Tätä varten he ovat hankkineet monia ainutlaatuisia mukautuksia, jotka voivat muuttaa isännän käyttäytymistä ja tehdä heistä alttiimpia saalistajilleen. Tämä prosessi mahdollistaa loisvaiheiden siirtämisen isännästä toiseen. Loisten elinympäristöstä riippuenne voidaan luokitella endoparasiiteiksi ja ektoparasiiteiksi.
