Keskeinen ero prokaryoottisen ja eukaryoottisen transkription välillä on se, että prokaryoottinen transkriptio tapahtuu sytoplasmassa, kun taas eukaryoottinen transkriptio tapahtuu ytimen sisällä.
Solussa DNA kuljettaa tietoa sukupolvelta toiselle kontrolloimalla solun toimintaa. Lisäksi DNA on vastuussa kaikkien proteiinien synteesistä, joilla on sekä toiminnallinen että rakenteellinen rooli solussa. Siksi syntetisoimalla tällaisia proteiineja DNA kontrolloi solun toimintaa. Geeni, joka sisältää geneettisen tiedon proteiinin tuottamiseksi, tulisi ilmoittaa vastaavan proteiinin syntetisoimiseksi. Geeniekspressio tapahtuu kahdella päävaiheella, nimittäin transkriptiolla ja translaatiolla. Näin ollen transkriptio on geeniekspression ensimmäinen vaihe. Sitä seuraa käännös. Transkription aikana DNA: n geneettinen informaatio muuttuu kolmikirjaimiseksi geneettiseksi koodisekvenssiksi mRNA: ssa. Translaation aikana mRNA muunnetaan polypeptidiketjuksi.