Keskeinen ero makroskooppisen ja mikroskooppisen välillä on se, että termi makroskooppinen viittaa paljaalla silmällä näkyviin aineisiin, kun taas termi mikroskooppinen viittaa aineisiin, jotka eivät ole paljaalle silmälle näkymättömiä.
Termit makroskooppinen ja mikroskooppinen viittaavat kahteen eri asteikkoon, jotka ovat hyödyllisiä määritettäessä eri yhdisteiden kokoa. Makroskooppiset aineet ovat riittävän suuria, jotta ne voidaan nähdä paljaalla silmällä ilman suurentavaa instrumenttia. Päinvastoin, mikroskooppiset aineet ovat hyvin pieniä, jotka eivät ole riittävän suuria paljaalla silmällä havaittaviksi. Siksi tarvitsemme suurennuslaitteen, kuten mikroskoopin, näiden aineiden tutkimiseen.