Keskeinen ero agglutinogeenien ja agglutiniinien välillä on, että agglutinogeenit ovat minkä tahansa tyyppisiä antigeenejä tai vieraita kappaleita, jotka aktivoivat agglutiniinivasta-aineiden valmistuksen, kun taas agglutiniinit ovat vasta-aineita, joita immuunijärjestelmämme tuottaa antigeenejä vastaan.
Agglutinaatio on aggregaatioiden muodostumisprosessi, joka johtuu vasta-aineiden ja antigeenien yhdistelmästä. Se käsittää kaksi vaihetta; alkusitoutuminen tai herkistyminen ja hilan muodostuminen. Se on eräänlainen immuunivaste patogeenisten mikrobien ja aineiden poistamiseksi kehostamme. Agglutinaatiota käytetään veriryhmien ja muiden patologisten kokonaisuuksien havaitsemiseen.