Tärkein ero XSS: n ja SQL-injektion välillä on se, että XSS (tai Cross Site Scripting) on tietoturva-aukkojen tyyppi, joka ruiskuttaa verkkosivustolle haitallista koodia niin, että selain suorittaa koodin kyseisen sivuston käyttäjille samalla kun SQL-injektio on toinen verkkosivustojen hakkerointimekanismi, joka lisää SQL-koodin verkkolomakkeen syöttöruutuun resurssien saamiseksi tai tietojen muuttamiseksi.
Jokainen organisaatio ylläpitää verkkosivustoja, jotka auttavat parantamaan liiketoimintaa ja kannattavuutta. Verkkosovellus sisältää asiakas- ja palvelinpuolen. Asiakaspuoli sisältää käyttöliittymät vuorovaikutuksessa sovelluksen kanssa. Palvelinpuoli sisältää tietokannan. Yleensä on olemassa uhkia, jotka vaikuttavat sovelluksen moitteettomaan toimintaan. Kaksi niistä on XSS ja SQL-injektio.