Keskeinen ero kiinteän tilan käymisen ja upotetun käymisen välillä on se, että kiinteässä tilassa käyminen käsittää mikro-organismien viljelyn kiinteällä substraatilla, jolla on alhainen kosteuspitoisuus, kun taas veden alla käymiseen liittyy mikro-organismien viljely nestemäisessä väliaineessa, jonka vesipitoisuus on yli 95%.
Mikro-organismit ovat hyödyllisiä erityyppisillä teollisuudenaloilla. Bakteereilla ja sienillä on erityisesti laaja valikoima sovelluksia teollisuudessa. Mikro-organismeja tulisi kasvattaa suuressa mittakaavassa teollisen käymisprosessin aikana tarvittavien mikrobimetaboliasta johtuvien tuotteiden erottamiseksi. Kiinteän tilan käyminen ja upotettu käyminen ovat kahta pääkäyttötyyppiä, jotka auttavat tuottamaan entsyymejä teollisesti. Kiinteässä tilassa tapahtuvassa käymisessä käyminen tapahtuu kiinteällä alustalla kasvatetuilla mikro-organismeilla, kun taas upotetussa käymisessä käyminen tapahtuu nestemäisessä väliaineessa kasvatetuilla mikro-organismeilla. Jokaisella menetelmällä on sekä etuja että haittoja.