Keskeinen ero D- ja L-glukoosin välillä on se, että D-glukoosissa kolme hydroksyyliryhmää ja yksi vetyryhmä ovat oikealla puolella, kun taas L-glukoosissa kolme hydroksyyliryhmää ja yksi vetyryhmä ovat vasemmalla puolella.
D-glukoosin ja L-glukoosin nimissä olevia D- ja L-kirjainmerkintöjä käytetään erottamaan glukoosimolekyylin rakenteelliset erot. Näitä kahta muotoa kutsutaan enantiomeereiksi, koska niiden molekyylirakenteet ovat toistensa peilikuvia. Siksi tärkein ero D- ja L-glukoosin välillä on niiden rakenteessa. Voimme selittää niiden muotojen erot käyttämällä Fisherin projektiomallia; se on yksi tapa piirtää orgaanisia molekyylejä.