Keskeinen ero insertio- ja korvausvektoreiden välillä on se, että insertiovektorilla on kyky insertoida kohtuullisen pituista vierasta DNA: ta, kun taas korvausvektorilla on kyky sijoittaa suurempia vieraita DNA-pituuksia.
Faagivektorit ovat bakteerifageja, joita käytetään kloonaukseen. Faagivektoreita on kahta tyyppiä; ne ovat insertiovektori ja korvausvektori. Lisäksi kaikki faagivektorit koostuvat ei-välttämättömistä geeneistä. Nämä geenit on kuitenkin poistettava faageista uusien vieraiden DNA-inserttien helpottamiseksi.
