Tärkein ero - VNTR vs. STR
DNA-tutkimuksilla on valtava hyöty filogeneettisten suhteiden ymmärtämisessä ja määrittämisessä, geneettisten sairauksien diagnosoinnissa ja organismin genomien kartoittamisessa. Useita DNA-analyyseihin liittyviä tekniikoita käytetään tietyn geenin tai DNA-sekvenssin tunnistamiseen tuntemattoman DNA-poolissa. Ne tunnetaan geneettisinä markkereina. Geneettisiä markkereita käytetään molekyylibiologiassa yksilöiden ja lajien välisen geneettisen vaihtelun tunnistamiseksi. Vaihtelevan lukumäärän tandemitoisto (VNTR) ja lyhyt tandemtoisto (STR) ovat kahden tyyppisiä geneettisiä markkereita, jotka osoittavat polymorfisuutta yksilöiden keskuudessa. Molemmat tyypit ovat koodaamatonta toistuvaa DNA: ta, jotka ovat tandem-toistoja. Ne on järjestetty päätä hännän muotoon kromosomeissa. VNTR on genomin osa, jossa lyhyt nukleotidisekvenssi toistetaan useita kertoja. STR on toinen DNA-osa genomissa, joka on järjestetty toistuviksi yksiköiksi, jotka koostuvat kahdesta kolmetoista nukleotidista sata kertaa. Tärkein ero VNTR: n ja STR: n välillä on toistuvien sekvenssien nukleotidien lukumäärä. VNTR: n toistuvat yksiköt koostuvat 10-100 nukleotidista, kun taas STR: n toistuvat yksiköt koostuvat 2-13 nukleotidista. VNTR: tä ja STR: ää käytetään laajasti oikeuslääketieteellisissä tutkimuksissa.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja avainero
2. Mikä on VNTR
3. Mikä on STR
4. VNTR: n ja STR: n yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - VNTR vs STR taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mikä on VNTR?
Tandem-toisto on lyhyt DNA-sekvenssi, joka toistetaan päästä päähän -muotoon tietyllä kromosomaalisella lokuksella. Tandem-toistossa ei ole muuta sekvenssiä tai nukleotidia. Genomissa on useita tandem-toistoja. VNTR on eräänlainen tandemtoisto niiden joukossa, jossa on toistuvia yksiköitä, jotka koostuvat 10-100 nukleotidista. VNTR on eräänlainen minisatelliitti. Nämä tandemtoistot löytyvät monista kromosomeista. Ne ovat läpäissyt ihmisen genomin ja sijaitsevat pääasiassa kromosomien subtelomeerisillä alueilla.
VNTR: t osoittavat tandem-toistuvan polymorfismin yksilöiden keskuudessa. VNTR: n pituus tietyssä kromosomin kohdassa on hyvin vaihteleva yksilöiden keskuudessa johtuen toistuvien yksiköiden lukumäärän vaihtelusta kyseisessä DNA-osiossa. Siksi VNTR: ää voidaan käyttää tehokkaana työkaluna yksilöiden tunnistamisessa, ja VNTR-analyysiä hyödynnetään monilla aloilla, mukaan lukien genetiikka, biologiatutkimus, rikostekninen tutkimus ja DNA-sormenjälki. VNTR: t olivat ensimmäiset geneettiset markkerit, joita käytettiin luuydinsiirteen siirteen kvantifiointiin. VNTR: t olivat myös ensimmäisiä polymorfisia markkereita, joita käytettiin rikosteknologian DNA-profiloinnissa.
Kuva 01: VNTR: n vaihtelu kuudessa yksilössä
VNTR-analyysi suoritetaan restriktiofragmentin pituuden polymorfismin kautta, jota seuraa eteläinen hybridisaatio. Siksi se tarvitsee verrattain suuren DNA-näytteen. Myös VNTR-profiilin tulkinta on ongelmallista. Näiden rajoitusten takia VNTR: n käyttö rikosteknologiassa on ollut rajallista ja se korvataan STR-analyysillä.
Mikä on STR?
STR on erittäin toistuva DNA-osa, joka koostuu kahdesta kolmetoista nukleotidia toistuvasta yksiköstä, jotka on järjestetty tandem-tavalla. STR on samanlainen kuin VNTR. Mutta se vaihtelee VNTR: stä toistuvien sekvenssien nukleotidien lukumäärästä ja toistojen lukumäärästä. STR on eräänlainen mikrosatelliitti.
STR-analyysi, joka liittyy toistuvien yksiköiden tarkan lukumäärän mittaamiseen. STR: t ovat hyvin vaihtelevia yksilöiden keskuudessa, samanlaisia kuin VNT: t. STR-profiilit vaihtelevat henkilöittäin. Siksi STR-analyysiä käytetään molekyylibiologiassa kahden tai useamman näytteen DNA: n spesifisten lokusten vertaamiseen. Siksi STR: itä pidetään voimakkaina geneettisinä markkereina molekyylibiologiassa. Se tarjoaa erinomaisen työkalun yksilöiden tunnistamiseen, koska heillä on suuri polymorfismi ja suhteellisen lyhyt pituus.
Tällä hetkellä STR: t ovat yleisimmin käytetty analysoitu geneettisen polymorfismin työkalu rikosteknisessä genetiikassa. Suurin osa oikeuslääketieteellisistä tapauksista liittyy STR-polymorfiseen analyysiin. STR-lokukset ovat levinneet koko genomiin. Kromosomeissa on tuhansia STR: itä, joita voidaan käyttää rikostutkinnassa. STR-analyysi ei sisällä restriktiopituuden polymorfismia, kuten VNTR-analyysi. STR-analyysi ei leikkaa DNA: ta restriktioentsyymeillä. Spesifisiä koettimia käytetään haluttujen alueiden kiinnittämiseen DNA: han ja käyttämällä PCR-tekniikkaa määritetään STR: n pituudet.
Kuva 02: STR-vaihtelu näytteiden välillä
Mitkä ovat yhtäläisyydet VNTR: n ja STR: n välillä?
- VNTR ja STR ovat koodaamatonta DNA: ta.
- Molemmat ovat tandem-toistoja.
- Molemmat osoittavat yksilöiden keskuudessa polymorfiaa johtuen eroista DNA-osan pituudessa.
- Molempia käytetään voimakkaina geneettisinä markkereina DNA-sormenjäljissä ja rikostutkimuksissa.
Mikä on ero VNTR: n ja STR: n välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
VNTR vs. STR |
|
| VNTR on ei-koodaava toistuva DNA, jolla on lyhyt nukleotidisekvenssi, joka toistetaan tandem-tavalla. | STR on erittäin toistuva DNA-osa, joka koostuu kahdesta kolmetoista nukleotidia toistuvasta yksiköstä, jotka on järjestetty tandem-tavalla. |
| Koko | |
| VNTR: t ovat suurempia kuin STR: t. | STR: t ovat pienempiä kuin VNTR: t. |
| Nukleotidien määrä toistuvassa sekvenssissä | |
| VNTR: n toistuva yksikkö koostuu 10 - 100 nukleotidista. | STR: n toistuva yksikkö koostuu 2 - 13 nukleotidista. |
Yhteenveto - VNTR vs. STR
VNTR ja STR ovat kaksi voimakasta geneettistä markkeria, joita käytetään molekyylibiologiassa, erityisesti rikosteknisen genetiikan alalla. VNTR on eräänlainen minisatelliitti ja STR on mikrosatelliitti. VNTR ja STR ovat koodaamatonta, erittäin toistuvaa DNA: ta. Ne ovat tandem-toistoja. VNTR: n ja STR: n yleinen rakenne on sama. Kuitenkin nukleotidien määrä toistuvassa sekvenssissä ja pituus ovat erilaiset. VNTR: llä on toistuvia sekvenssejä, jotka koostuvat 10 - 100 nukleotidista. STR: llä on toistuvia sekvenssejä, jotka koostuvat 2 - 13 nukleotidista. Tämä on ero VNTR: n ja STR: n välillä.
Lataa PDF-versio VNTR vs STR
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainausmerkintöjen mukaan. Lataa PDF-versio täältä Ero VNTR: n ja STR: n välillä.
