Tärkein ero - pohjan poisto korjaus vs. nukleotidien leikkaus korjaus
DNA kärsii usein vahingoista useiden sisäisten ja ulkoisten tekijöiden vuoksi. Solukorjausjärjestelmät korjaavat vahingot kuitenkin välittömästi ja jatkuvasti, ennen kuin niistä tulee mutaatioita tai ennen kuin ne siirretään seuraaville sukupolville. Soluissa on kolmen tyyppisiä leikkauksen korjausjärjestelmiä: nukleotidien leikkauskorjaus (NER), emäksen leikkauskorjaus (BER) ja DNA-epäsuhta korjaus (MMR) yksijuosteisten DNA-vaurioiden korjaamiseksi. Tärkein ero emäksen leikkauksen korjauksen ja nukleotidien korjaamisen välillä on se, että peruspoiston korjaus on yksinkertainen korjausjärjestelmä, joka toimii soluissa yksittäisten nukleotidivaurioiden korjaamiseksi endogeenisesti, kun taas nukleotidien leikkauskorjaus on monimutkainen korjausjärjestelmä, joka toimii soluissa korjaamaan verrattain suuremmat, vaurioituneet alueet aiheuttavat eksogeenisesti.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja tärkein ero
2. Mikä on pohjan leikkauksen korjaus
3. Mikä on nukleotidien leikkauksen korjaus
4. Vertailu vierekkäin - Pohjan leikkauksen korjaus vs Nukleotidin leikkaus
5. Yhteenveto
Mikä on Base Excision Repair?
Pohjanpoistokorjaus on yksinkertaisin versio solujen DNA-korjausjärjestelmästä. Sitä käytetään pienien DNA-vaurioiden korjaamiseen. DNA-emäkset ovat modifioituja deaminaation tai alkyloinnin vuoksi. Kun emäsvaurioita esiintyy, DNA-glykosylaasi tunnistaa ja aktivoi emäksen poisto-korjausjärjestelmän ja palauttaa sen entsyymien AP-endonukleaasin, DNA-polymeraasin ja DNA-ligaasin avulla. Seuraavat vaiheet liittyvät BER-järjestelmään.
- Väärän tai vaurioituneen emäksen tunnistaminen ja poistaminen DNA-glykosylaasilla abaasikohdan luomiseksi (emäshäviöpaikat –apiuriini- tai apyrimidiinikohteet).
- Apuriinisen / apyrimidiinisen endonukleaasin aiheuttama viillon paikka
- Jäljellä olevan sokerifragmentin poistaminen lyaasilla tai fosfodiesteraasilla
- Aukon täyttäminen DNA-polymeraasilla
- Lempin sinetöinti DNA-ligaasilla
Kuva 01: Pohjan leikkausreitti
Mikä on nukleotidien poisto korjaus?
Nukleotidien leikkauskorjaus (NER) on tärkeä DNA: n leikkausten korjausjärjestelmä soluissa. Se pystyy korjaamaan ja korvaamaan vaurioituneet alueet, joiden pituus on enintään 30 emästä, ja sitä ohjaa vahingoittumaton mallinauha. Yleisiä DNA-vaurioita esiintyy ultraviolettisäteilyn takia, ja NER suojaa DNA: ta korjaamalla nämä vauriot välittömästi ennen mutaatioiden muodostumista ja siirtymistä tuleville sukupolville tai aiheuttavat sairauksia. NER tarjoaa nimenomaisen suojan eksogeenisten tekijöiden, kuten ympäristö- ja kemiallisten karsinogeenien, epäsuorasti aiheuttamilta mutaatioilta. NER nähdään melkein kaikissa organismeissa, ja se tunnistaa vahingot, jotka aiheuttavat merkittäviä vääristymiä DNA-kierukassa.
NER-prosessi sisältää monien proteiinien, kuten XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB jne., Toiminnan ja etenee useiden leikattujen ja tahnamaisten mekanismien kautta. Nämä proteiinit ovat välttämättömiä korjausprosessin loppuunsaattamiseksi, ja yhden NER-proteiinin vika on elintärkeää ja voi aiheuttaa harvinaisia resessiivisiä oireyhtymiä: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne-oireyhtymä (CS) ja hauraiden hiusten häiriöiden valoherkkä muoto. trikotioodystrofia (TTD).
Kuva 02: Nukleotidien leikkauskorjaus
Mitä eroa on Base Excision Repair ja Nucleotide Excision Repair välillä?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Pohjan leikkauskorjaus vs. nukleotidien leikkauskorjaus |
|
| Base excision repair (BER) on soluissa esiintyvä DNA-korjausjärjestelmä. | Nukleotidien leikkauskorjaus (NER) on toinen soluista löytyvä DNA-korjausjärjestelmä. |
| Tunnistetaan DNA-adduktit | |
| BER korjaa pienten DNA-addukttien vauriot. | NER korjaa suuret DNA-adduktit. |
| DNA-vauriot | |
| BER tunnistaa vahingot, jotka eivät aiheuta merkittäviä vääristymiä DNA-kierukalle. | NER tunnistaa vahingot, jotka aiheuttavat merkittäviä vääristymiä DNA-kierukalle. |
| DNA-vaurioiden syyt | |
| BER korjaa endogeenisten mutageenien aiheuttamat vahingot. | NER korjaa eksogeenisten mutageenien aiheuttamat vahingot. |
| Monimutkaisuus | |
| BER on vähiten monimutkainen korjausjärjestelmä | Se on monimutkaisempi kuin BER. |
| Tarve proteiineille | |
| BER ei vaadi muita proteiineja. | NER vaatii useita geenituotteita, erityisesti proteiineja, vaurioituneiden ja vahingoittumattomien alueiden erottamiseksi. |
| Soveltuvuus | |
| BER soveltuu yhden pohjan vaurioiden korjaamiseen. | NER soveltuu vaurioituneiden alueiden korvaamiseen. |
Yhteenveto - peruskudoksen korjaus vs. nukleotidien leikkauskorjaus
NER ja BER ovat kahta tyyppiä soluissa esiintyviä DNA: n poisto-korjausprosesseja. BER pystyy korjaamaan pienet endogeenisesti aiheutetut vahingot, kun taas NER pystyy korjaamaan enintään 30 emäsparin pituiset vahingot, jotka ovat enimmäkseen eksogeenisiä. BER eroaa NER: stä tunnistettujen substraattien tyypeissä ja alkuvaiheen pilkkoutumistapahtumassa. BER tunnistaa myös vahingot, joita ei aiheuttanut merkittävät vääristymät DNA-kierteessä, kun taas NER tunnistaa merkittävät vääristymät DNA-kierukassa. Tämä on ero emäksen leikkauksen korjaamisen ja nukleotidien leikkaamisen välillä.
Kuva Kohteliaisuus:
1. "Dna repair base excersion en", kirjoittanut LadyofHats - (Public Domain) Commons Wikimedia -palvelun kautta
2. "Kaavioesitys malleista Uvr-proteiinien ohjaamalle nukleotidien leikkausreitille", Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui ja Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) Commons Wikimedia -palvelun kautta
