Tärkein ero kodinomanssin ja useiden alleelien välillä on, että kodinomanssi ilmentää molempien alleelien vaikutuksia itsenäisesti, sekoittumatta heterotsygoottisessa tilassa, kun taas useat alleelit viittaavat sellaisen piirteen tilaan, jolla on enemmän kuin kaksi erilaista alleelia.
Yleensä jokaisella geenillä on kaksi erilaista alleelia. Yksi on hallitseva alleeli, kun taas toinen on resessiivinen alleeli. Mendelin perinnön mukaan dominoiva alleeli ilmaisee fenotyyppinsä ja samalla tukahduttaa resessiivisen alleelin heterotsygoottisessa tilassa. Joillakin geeneillä on kuitenkin vähintään kolme erilaista alleelia yhdelle piirteelle. Niitä kutsutaan useiksi alleeleiksi. Lisäksi codominance on ei-Mendelin perintö. Tässä ilmiössä jälkeläiset saavat molemmat vanhemmat geenit molempien geenien yhdistelmänä. Siksi molemmat geenit ilmentyvät jälkeläisissä yhtä paljon.
