Keskeinen ero hallitsevien ja resessiivisten alleelien välillä on, että hallitsevat alleelit ovat alleeleja, jotka antavat fenotyypin, peittäen toisen fenotyypin, kun taas resessiiviset alleelit ovat alleeleja, jotka hallitseva alleeli tukahduttaa.
Yleensä kromosomi sisältää useita geenejä, ja niitä esiintyy tietyissä paikoissa. Jos homologisissa kromosomeissa on geenejä samassa paikassa, niiden sanotaan olevan sama. Koska ne ovat läsnä äidin ja isän kromosomin samoissa paikoissa, näillä geeneillä on sama ominaisuus. Ne ovat geenin vaihtoehtoisia muotoja; me kutsumme näitä alleeleja. Alleelit voivat olla hallitsevia tai resessiivisiä. Hallitseva alleeli antaa aina sen koodaaman fenotyypin, kun taas resessiivinen alleeli antaa fenotyypin vain, kun se on läsnä homotsygoottisessa tilassa. Itse asiassa dominointi ja recessivity ovat kahden alleelin fenotyyppinen korrelaatio.
