Keskeinen ero molekyylirata- ja hybridisaatioteorian välillä on se, että molekyyliorbiittiteoria kuvaa sidos- ja sitoutumisen kiertoradan muodostumista, kun taas hybridisaatioteoria kuvaa hybridiorbitaalien muodostumista.
Molekyylien elektronisten ja kiertorakenteiden määrittämiseksi on kehitetty erilaisia teorioita. VSEPR-teoria, Lewis-teoria, valenssisidoteoria, hybridisaatioteoria ja molekyylirata-aineen teoria ovat niin tärkeitä teorioita. Hyväksyttävin teoria niiden joukossa on molekyylirata-teoria.