Keskeinen ero genomin ja geenipoolin välillä on, että genomi viittaa koko organismin DNA: han, kun taas geenipooli viittaa täydelliseen risteytyvän populaation ainutlaatuisiin geeneihin.
Geeni on perinnöllisyyden perusrakenne. Geenit siirtyvät vanhemmilta jälkeläisille sukusolujen kautta. Niitä on myös organismin genomissa. Genomi on organismin täydellinen DNA-sarja. Geenivarasto on myös samanlainen termi. Mutta se edustaa kaikkien populaatiossa tai lajissa olevien geenien kokoelmaa. Toisin kuin genomi, geenivarasto on sekoitus populaation geenejä. Sen mukaisesti geenivarasto edustaa kaikkia mahdollisia alleeleja, joita esiintyy kyseisessä populaatiossa.
