Keskeinen ero hierarkkisen ja koko genomin haulikon sekvensoinnissa on se, että hierarkkisessa haulikon sekvensoinnissa genomi hajotetaan suuremmiksi fragmenteiksi ennen sekvensointia, kun taas koko genomin haulikon sekvensoinnissa koko genomi hajotetaan pieniksi fragmenteiksi sekvensoimiseksi.
Sekvensointi on tärkeä tekniikka molekyyliprosesseissa, erityisesti lajien tarkassa tunnistamisessa. Itse asiassa se on tekniikka geenin tai genomin nukleotidien tarkan järjestyksen tunnistamiseksi. Sekvensointiin on monia tekniikoita. Jotkut näistä sisältävät Maxam Gilbert -menetelmän, Sanger-menetelmän ja automatisoidun Sanger-menetelmän.