Tärkein ero E. colin ja Klebsiellan välillä on, että E. coli on gram-negatiivinen sauvanmuotoinen bakteeri, joka on liikkuva, kun taas Klebsiella on gram-negatiivisten sauvan muotoisten bakteerien suku, joka on liikkumaton.
Escherichia ja Klebsiella ovat kaksi yleistä koliformisten bakteerien sukua. Molemmat suvut koostuvat gram-negatiivisista, sauvanmuotoisista, itiöitä muodostamattomista bakteereista. E. coli on Escherichia-laji. Se on liikkuva ulosteen koliforminen bakteeri. Sekä E. coli- että Klebsiella-bakteerit kuuluvat Enterobacteriaceae-perheeseen. Ne ovat osa normaalia kasvistoa suolistossa. Lisäksi ne ovat fakultatiivisia anaerobeja. Molemmat ovat yleensä vaarattomia, mutta niistä tulee opportunistisia ihmisen taudinaiheuttajia tietyissä tilanteissa.